RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 LIASO43766 372 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 MX2P20592 715 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 STIP1P31948 543 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ELK3P41970 407 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 CD97P48960 835 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 NR1H2P55055 460 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PKNOX1P55347 436 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ITPK1Q13572 414 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 C16orf46Q6P387 395 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 FBXO33Q7Z6M2 555 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TSPAN14Q8NG11 270 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 DDI1Q8WTU0 396 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PLGRKTQ9HBL7 147 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 BCL9O00512 1426 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 E9PBE3 544 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 FAM86B1E9PN63 330 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 DCXO43602 365 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 KLHL41O60662 606 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 GAS7O60861 476 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 CFBP00751 764 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 FAM86B2P0C5J1 330 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PSMC3P17980 439 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 RFX1P22670 979 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 CDH15P55291 814 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ESRRGP62508 458 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PHEXP78562 749 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 FLOT2Q14254 428 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 FAXCQ5TGI0 409 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 UTS2BQ765I0 119 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 CBWD2Q8IUF1 395 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PQLC1Q8N2U9 271 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 HAUS8Q9BT25 410 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 NDEL1Q9GZM8 345 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 COQ6Q9Y2Z9 468 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SCINQ9Y6U3 715 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 KBTBD13C9JR72 458 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 F5H6K3 240 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 KRT37O76014 449 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PROSCO94903 275 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 RBP3P10745 1247 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 COL6A2P12110 1019 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TCF4P15884 667 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 KLRC2P26717 231 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 NUDT2P50583 147 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SIK1P57059 783 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF543Q08ER8 600 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 MCOLN2Q8IZK6 566 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 DDHD1Q8NEL9 900 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TAS1R2Q8TE23 839 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 MAN1C1Q9NR34 630 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 FAIMQ9NVQ4 179 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 MTMR4Q9NYA4 1195 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 HSPBP1Q9NZL4 362 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 FBP2O00757 339 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 MSH4O15457 936 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 KCNA4P22459 653 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 GPSM2P81274 684 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ITGA7Q13683 1181 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SLC51AQ86UW1 340 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 FAM71DQ8N9W8 422 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 JADE3Q92613 823 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SEMA4DQ92854 862 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 WRNIP1Q96S55 665 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ACSS3Q9H6R3 686 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 STRIP2Q9ULQ0 834 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PLA2G4CQ9UP65 541 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 HTR3EA5X5Y0 456 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 F5H423 210 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 NEMP1O14524 444 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 DNAJA2O60884 412 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 AVILO75366 819 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 CSPG5O95196 566 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PORP16435 677 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SLC18A1P54219 525 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 KCNT1Q5JUK3 1230 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 LGSNQ5TDP6 509 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 OGFOD2Q6N063 350 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 FAM71AQ8IYT1 594 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 RIN3Q8TB24 985 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 NLRP7Q8WX94 980 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms