RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 CLCN3P51790 818 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC7A5Q01650 507 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 ENPEPQ07075 957 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 BFSP1Q12934 665 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 SPDYCQ5MJ68 293 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 MICALCLQ6ZW33 695 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 OTUD6AQ7L8S5 288 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 SLFN11Q7Z7L1 901 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 RASGEF1CQ8N431 466 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 METTL13Q8N6R0 699 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 XXYLT1Q8NBI6 393 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 KIFAP3Q92845 792 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 BORCS6Q96GS4 357 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 CDHR1Q96JP9 859 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMB7Q99436 277 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 SH3GL2Q99962 352 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 ISCUQ9H1K1 167 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 SIX2Q9NPC8 291 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKEF1Q9NU02 776 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 SAMM50Q9Y512 469 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 NOTCH4Q99466 2003 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 MEIS3P2A8K0S8 358 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SFI1A8K8P3 1242 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR64B1ANS9 1081 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBTB42B2RXF5 422 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ANHXE9PGG2 379 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 F8VZ95 297 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 BACH1O14867 736 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 TBC1D4O60343 1298 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 RTN2O75298 545 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ZMYND10O75800 440 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 C22orf31O95567 290 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 GALTP07902 379 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 LAMP2P13473 410 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 PLS3P13797 630 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 GTF2H1P32780 548 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC11A1P49279 550 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 DNA2P51530 1060 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 VAMP7P51809 220 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 GALCP54803 685 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 GYS2P54840 703 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 MFAP3P55082 362 aa7.46□□□□□ -1.22
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SMARCE1-201ENST00000264640 PSMC5P62195 406 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 BIRC3Q13489 604 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 TCEAL1Q15170 157 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 PTPRNQ16849 979 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SEL1L2Q5TEA6 688 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 PARM1Q6UWI2 310 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 B3GNT9Q6UX72 402 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 C4orf19Q8IY42 314 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 EFCAB13Q8IY85 973 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC57Q8N9N7 239 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 MAIP1Q8WWC4 291 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 NELL1Q92832 810 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 FGF14Q92915 247 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SHDQ96IW2 340 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 CEP89Q96ST8 783 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 AGPAT1Q99943 283 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 PACSIN1Q9BY11 444 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM129AQ9BZQ8 928 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 CARD9Q9H257 536 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 C17orf75Q9HAS0 396 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 PIDD1Q9HB75 910 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 LTB4R2Q9NPC1 389 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SEMA4GQ9NTN9 838 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 TBC1D13Q9NVG8 400 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 PARP2Q9UGN5 583 aa7.46□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB23Q9ULC3 237 aa7.46□□□□□ -1.22
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