RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 RARBP10826 455 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 PYGBP11216 843 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 ICAM3P32942 547 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 SERPINB4P48594 390 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC34A1Q06495 639 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNJ11Q14654 390 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC6Q16204 474 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 IRGCQ6NXR0 463 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS52Q8N1B4 723 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 NRG4Q8WWG1 115 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC17Q96AE7 1141 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 KIF3CO14782 793 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 MSCO60682 206 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 PSMG1O95456 288 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 TRPC3Q13507 836 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 MCUR1Q96AQ8 359 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT36O76013 467 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 C1QAP02745 245 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 PDHA1P08559 390 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 BACE1P56817 501 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 ACAP1Q15027 740 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 XYLT1Q86Y38 959 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 LRCH1Q9Y2L9 728 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 FCHO1O14526 889 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 MED7O43513 233 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 MYL2P10916 166 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF699Q32M78 642 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR78Q5VTH9 848 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 ZBTB33Q86T24 672 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 RSAD1Q9HA92 442 aa23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 OGTO15294 1046 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 EFNA5P52803 228 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 EMC1Q8N766 993 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 SPATA18Q8TC71 538 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 SYT15Q9BQS2 421 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 YIPF3Q9GZM5 350 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 MAF1Q9H063 256 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS33BQ9H267 617 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGEF4Q9NR80 690 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 CHADO15335 359 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 ENDOD1O94919 500 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 MIPP30301 263 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 NOMO1Q15155 1222 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC26A11Q86WA9 606 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR60Q8WVS4 1066 aa23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 ACAD9Q9H845 621 aa23.09■■□□□ 1.29
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HTATSF1-201ENST00000218364 NEFHP12036 1026 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 RAP1GDS1P52306 607 aa23.08■■□□□ 1.29
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HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 TAF5Q15542 800 aa23.08■■□□□ 1.29
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HTATSF1-201ENST00000218364 CPXM1Q96SM3 734 aa23.08■■□□□ 1.29
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HTATSF1-201ENST00000218364 KCNK4Q9NYG8 393 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF180Q9UJW8 692 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 CLGNO14967 610 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 TBX10O75333 385 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 TUBP50607 506 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
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HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC7BQ86TV6 843 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 TTLL6Q8N841 843 aa23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 C7orf26Q96N11 449 aa23.08■■□□□ 1.29
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HTATSF1-201ENST00000218364 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1-201ENST00000218364 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
HTATSF1-201ENST00000218364 CAPN9O14815 690 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-201ENST00000218364 ERBB2P04626 1255 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-201ENST00000218364 PEX19P40855 299 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-201ENST00000218364 NRLP54845 237 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-201ENST00000218364 SESN3P58005 492 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-201ENST00000218364 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGAP24Q8N264 748 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-201ENST00000218364 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-201ENST00000218364 COPEO14579 308 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-201ENST00000218364 MAGEC1O60732 1142 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-201ENST00000218364 MAFO75444 373 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-201ENST00000218364 SKIP12755 728 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-201ENST00000218364 CD19P15391 556 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-201ENST00000218364 SATB1Q01826 763 aa23.07■■□□□ 1.28
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