RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OR10T2Q8NGX3 314 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMC2Q8TDI7 906 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GIPC2Q8TF65 315 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EXOC4Q96A65 974 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TSG101Q99816 390 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 L1RE1Q9UN81 338 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 WASF3Q9UPY6 502 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZZEF1O43149 2961 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GALK1P51570 392 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BIRC3Q13489 604 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SYT13Q7L8C5 426 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TOP6BLQ8N6T0 577 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ACDQ96AP0 544 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM9BQ9NQ34 198 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EML5Q05BV3 1969 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KRT13P13646 458 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CEACAM1P13688 526 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PPP1R2P41236 205 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 VAMP7P51809 220 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DGKEP52429 567 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DLG4P78352 724 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CLDN10P78369 228 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DMC1Q14565 340 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DPH6Q7L8W6 267 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SCNM1Q9BWG6 230 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KIF9Q9HAQ2 790 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TDP1Q9NUW8 608 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EBF1Q9UH73 591 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BIN1O00499 593 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PSMA7O14818 248 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CETN3O15182 167 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MYL6P60660 151 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PDGFRLQ15198 375 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CAMK4Q16566 473 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ADGRF2Q8IZF7 708 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SPATA18Q8TC71 538 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GBP4Q96PP9 640 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MMS19Q96T76 1030 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 INVSQ9Y283 1065 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IKBKBO14920 756 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CLSTN1O94985 981 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.825e-9■■■■□ 19.9
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ATICP31939 592 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GJA4P35212 333 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LHX1P48742 406 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MYL7Q01449 175 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TSPY1Q01534 308 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MORC3Q14149 939 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SOWAHAQ2M3V2 549 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TXNDC8Q6A555 127 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CYP2U1Q7Z449 544 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM150AQ86TG1 271 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CPA6Q8N4T0 437 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TSTD1Q8NFU3 115 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GATA6Q92908 595 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ABCA7Q8IZY2 2146 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NLRP12P59046 1061 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TNNC1P63316 161 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LRRC63Q05C16 580 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SMARCB1Q12824 385 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NCOA4Q13772 614 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 UAP1L1Q3KQV9 507 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PMS2CLQ68D20 193 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C11orf74Q86VG3 221 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OSTM1Q86WC4 334 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TTC16Q8NEE8 873 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms