RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Asb7Q91ZU0 318 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cul2Q9D4H8 745 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scyl3Q9DBQ7 735 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spock2Q9ER58 423 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ralgps2Q9ERD6 590 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dkc1Q9ESX5 509 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnajc12Q9R022 198 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scnn1bQ9WU38 638 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Morc1Q9WVL5 950 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r121A2BE32 847 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Srsf11E9Q6E5 511 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3138K7N754 218 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CaluO35887 315 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snx3O70492 162 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Akr1b8P45377 316 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ripk2P58801 539 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pfkfb2P70265 519 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxb13P70321 286 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Naif1Q6PFD7 327 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppm1kQ8BXN7 372 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adgrg3Q8R0T6 542 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd300ldQ8VCH2 221 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CarfQ8VHI4 689 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hsf2bpQ9D4G2 338 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PygmQ9WUB3 842 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ralgapa2A3KGS3 1872 aa13.22□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SktA2AQ25 1946 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ms4a14A0A087WSD2 1232 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc16a6B1AT66 607 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr310B2RVZ1 332 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pate3B3GLJ3 98 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttc7bE9Q6P5 843 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3164L7N2B9 238 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3264L7N2C5 238 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Unc5cO08747 931 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RpsaP14206 295 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pou3f3P31361 497 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sar1aP36536 198 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd86P42082 309 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rfx2P48379 717 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Frg1P97376 258 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ZufspQ3T9Z9 577 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FaxcQ3UMF9 409 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SkiQ60698 725 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kctd15Q8K0E1 283 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chst12Q99LL3 419 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mageb3Q9D2H4 330 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc4a11A2AJN7 862 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Baz2bA2AUY4 2123 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc10bG3XA50 292 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CflarO35732 481 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zscan2Q07230 614 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb8osQ505B7 168 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stip1Q60864 543 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phlda1Q62392 405 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vps72Q62481 368 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam160b1Q8CDM8 764 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ago3Q8CJF9 860 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ugt3a2Q8JZZ0 523 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GarsQ9CZD3 729 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gstt4Q9D4P7 240 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PirQ9D711 290 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Asah2Q9JHE3 756 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clec4aQ9QZ15 238 aa13.21□□□□□ -0.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr81Q5ND34 1934 aa13.21□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zscan4-ps1A0A1C7CYV3 506 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zscan4dA7KBS4 506 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r55G3UWZ4 781 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r53L7N473 806 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf19aP50636 840 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sparcl1P70663 650 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zscan4fQ3URS2 506 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ntan1Q64311 310 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arl5cQ6P068 179 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfyve28Q6ZPK7 905 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Suz12Q80U70 741 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zscan4cQ80VJ6 506 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbm12b1Q80YR9 836 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Creb3l2Q8BH52 521 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Heatr3Q8BQM4 679 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4933409G03RikQ8C5U0 320 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cuedc2Q9CXX9 284 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CtsfQ9R013 462 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kif9Q9WV04 790 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dpysl4O35098 572 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptp4a2O70274 167 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptpn11P35235 597 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2c38P56655 490 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sesn2P58043 480 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2j11Q3UNV2 504 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nlrp4eQ66X19 978 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IqceQ6PCQ0 778 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r26Q6TAC4 855 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr389Q7TRX7 312 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankzf1Q80UU1 748 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pan2Q8BGF7 1200 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hook3Q8BUK6 718 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trerf1Q8BXJ2 1205 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tp53inp2Q8CFU8 221 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r64Q8R2B8 320 aa13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.6 ms