RNA–Protein interactions for RNA: YKR067W

GPT2, Transcript of Glycerol-3-phosphate/dihydroxyacetone phosphate sn-1 acyltransferase, yeast

Gene GPT2, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GPT2	YKR067W	NRG2	P38082	220 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	SNF11	P38956	169 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	YGL262W	P53054	175 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	CRH1	P53301	507 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	AGA1	P32323	725 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	TDA2	P40045	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	RIP-Chip
GPT2	YKR067W	YGR269W	P40326	108 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	SVP26	P38869	228 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	YFL051C	P43552	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	KRE1	P17260	313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	SIP18	P50263	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	YLR296W	Q05898	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	YKL044W	P36092	106 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	YBR292C	P38357	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	YHL042W	P38729	150 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	AVO2	Q04749	426 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	FYV12	Q08559	129 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	TRA1	P38811	3744 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	ATP15	P21306	62 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	PAU4	P53427	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	YMR007W	Q03675	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	API2	Q04413	109 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	ROX3	P25046	220 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	YNL217W	P40152	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	PAU15	P40585	124 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	BET1	P22804	142 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	RPL39	P04650	51 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	YBL059W	P34224	193 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	PAU13	P38725	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	SPG1	P50088	95 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	PAU10	Q03050	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	PAU20	Q08322	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	EMC6	Q12431	108 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	TIM22	Q12328	207 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	MRPS9	P38120	278 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	MEC1	P38111	2368 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	YGL260W	P53056	76 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	YNR064C	P53750	290 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	YEL045C	P32616	141 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	TOM6	P33448	61 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	CTR2	P38865	189 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	YHP1	Q04116	353 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	MSA2	P36157	363 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	HAL1	Q01766	294 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	YLR156W	P0CE96	114 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	YLR159W	P0CE97	114 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	YLR161W	P0CE98	114 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	RPB9	P27999	122 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	YIL163C	P40448	117 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	QCR9	P22289	66 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	YHL037C	P38733	133 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	HUA1	P40325	198 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	SED1	Q01589	338 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	ATP20	Q12233	115 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	PAU5	P43575	122 aa		4.48	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.48	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.48	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	YKR045C	P36138	183 aa		4.48	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		4.48	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	YOR268C	Q08734	132 aa		4.47	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.47	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.46	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	PAU3	P25610	124 aa		4.46	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	COX14	P39103	70 aa		4.46	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	RRT13	P40042	185 aa		4.46	□□□□□ -1.69
GPT2	YKR067W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
GPT2	YKR067W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.46	□□□□□ -1.7

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 312.6 ms