RNA–Protein interactions for RNA: YBL078C

ATG8, Transcript of Component of autophagosomes and Cvt vesicles, yeastyeast

Gene ATG8, Length 354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG8YBL078C YBR209WP38311 105 aa2.8□□□□□ -1.96
ATG8YBL078C AIM11P87275 137 aa2.8□□□□□ -1.96
ATG8YBL078C UPS3Q04006 179 aa2.8□□□□□ -1.96
ATG8YBL078C CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
ATG8YBL078C TVP18Q04767 167 aa2.8□□□□□ -1.96
ATG8YBL078C YOL118CQ08259 102 aa2.8□□□□□ -1.96
ATG8YBL078C YOR015WQ12169 119 aa2.8□□□□□ -1.96
ATG8YBL078C DDI2P0CH63 225 aa2.79□□□□□ -1.96
ATG8YBL078C DDI3P0CH64 225 aa2.79□□□□□ -1.96
ATG8YBL078C SDH4P37298 181 aa2.79□□□□□ -1.96
ATG8YBL078C YEL067CP39978 195 aa2.79□□□□□ -1.96
ATG8YBL078C ELC1Q03071 99 aa2.79□□□□□ -1.96
ATG8YBL078C MIX17Q03667 156 aa2.79□□□□□ -1.96
ATG8YBL078C YDL241WQ07738 123 aa2.79□□□□□ -1.96
ATG8YBL078C YCL042WP25572 119 aa2.78□□□□□ -1.96
ATG8YBL078C YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
ATG8YBL078C GAT4P40569 121 aa2.78□□□□□ -1.96
ATG8YBL078C PHS1P40857 217 aa2.78□□□□□ -1.96
ATG8YBL078C NSE4P43124 402 aa2.78□□□□□ -1.96
ATG8YBL078C TMA23Q03525 211 aa2.78□□□□□ -1.96
ATG8YBL078C SEC11P15367 167 aa2.77□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C EMP24P32803 203 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YEA6P39953 335 aa2.77□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C KNH1P50112 268 aa2.77□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C CYT2Q00873 224 aa2.77□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YGL258W-AQ3E740 77 aa2.77□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YCR050CP25630 102 aa2.76□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C FPR2P32472 135 aa2.76□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YHR022CP38763 256 aa2.76□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C SPG1P50088 95 aa2.76□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YMR082CQ04276 118 aa2.76□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YLR146W-AQ2V2P1 62 aa2.76□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YHR213W-AQ8TGT4 77 aa2.76□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C UTP20P35194 2493 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C COX8P04039 78 aa2.75□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C INO4P13902 151 aa2.75□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C SFT2P38166 215 aa2.75□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C SVP26P38869 228 aa2.75□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C GCV3P39726 170 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C ERG25P53045 309 aa2.75□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C THG1P53215 237 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C POP3P53833 195 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C FIT2Q08906 153 aa2.75□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C EMC6Q12431 108 aa2.75□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YGL194C-AQ2V2P6 80 aa2.75□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C COA2Q3E823 68 aa2.75□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YOS1Q3E834 85 aa2.75□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C SCS22Q6Q595 175 aa2.75□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YKR045CP36138 183 aa2.74□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YHP1Q04116 353 aa2.74□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YDL012CQ12489 107 aa2.74□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C DYN1P36022 4092 aa2.74□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YER039C-AP0CD97 72 aa2.73□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C LST8P41318 303 aa2.73□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YJL144WP47009 104 aa2.73□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YCL001W-AP87012 153 aa2.73□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YML079WQ03629 201 aa2.73□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C COA4Q05809 96 aa2.73□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YBR292CP38357 123 aa2.72□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YHL042WP38729 150 aa2.72□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YAL064WP39711 94 aa2.72□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C YGR269WP40326 108 aa2.72□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C DAD4P69851 72 aa2.72□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C SAE3P89114 91 aa2.72□□□□□ -1.97
ATG8YBL078C CCW14O13547 238 aa2.71□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C QCR9P22289 66 aa2.71□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C UTR5P32630 166 aa2.71□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C EMC5P40540 141 aa2.71□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C LSM8P47093 109 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C DAD3P69850 94 aa2.71□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C YLR042CQ07990 161 aa2.71□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C PRM7Q12459 698 aa2.71□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C COX19Q3E731 98 aa2.71□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C RPB11P38902 120 aa2.7□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C ATP19P81451 68 aa2.7□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C SOM1Q05676 74 aa2.7□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C POC4Q12245 148 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C FYV7Q12247 151 aa2.7□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C KTI11Q3E840 82 aa2.7□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C YBL071CP38185 102 aa2.69□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C VPS55P47111 140 aa2.69□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C MIC27P50945 234 aa2.69□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C AVO2Q04749 426 aa2.69□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C YDL157CQ12082 118 aa2.69□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C YOR376W-AQ3E805 51 aa2.69□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C VMA9Q3E7B6 73 aa2.68□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C YHR213WP0CI67 198 aa2.67□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C SRB6P32570 121 aa2.67□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C SNN1P48232 102 aa2.67□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C YGL230CP53074 147 aa2.67□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C PAU4P53427 120 aa2.67□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C YMR007WQ03675 126 aa2.67□□□□□ -1.98
ATG8YBL078C HOR7Q05827 59 aa2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.7 ms