RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

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Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 CDC25AP30304 524 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 TIE1P35590 1138 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 GPR15P49685 360 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 ANAPC15P60006 121 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 FAM193AP78312 1265 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 KDSRQ06136 332 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF33AQ06730 810 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 PLEKHG6Q3KR16 790 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 GLRX5Q86SX6 157 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 LRRTM3Q86VH5 581 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 NT5DC4Q86YG4 428 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM86AQ8N2M4 240 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 NECAB1Q8N987 351 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 ADAM32Q8TC27 787 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 C8orf76Q96K31 380 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 CEP295NLQ96MC4 621 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 SLC22A12Q96S37 553 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 FSCN3Q9NQT6 498 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 ARHGEF4Q9NR80 690 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 DPP3Q9NY33 737 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 GCNT4Q9P109 453 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 A0A0B4J269 797 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 C2orf78A6NCI8 922 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 LEFTY2O00292 366 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 JAK2O60674 1132 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 HUS1O60921 280 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 IL18RAPO95256 599 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 ADH5P11766 374 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 HOXB2P14652 356 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 PCSK1P29120 753 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 PRPHP41219 470 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 GRIA2P42262 883 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 MAGEA11P43364 429 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 TNFRSF4P43489 277 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 GUCY1B3Q02153 619 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 NBR1Q14596 966 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 ME3Q16798 604 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 DDR2Q16832 855 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 SDHAF4Q5VUM1 108 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 BTBD8Q5XKL5 378 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 C4orf50Q6ZRC1 276 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 SCN4BQ8IWT1 228 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 FOXJ1Q92949 421 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 HSPA12BQ96MM6 686 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 CYP2S1Q96SQ9 504 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 ACBD6Q9BR61 282 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 SHROOM3Q8TF72 1996 aa9.26□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 GON4LQ3T8J9 2241 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 MYOFQ9NZM1 2061 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 PP2D1A8MPX8 630 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 TK2O00142 265 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 ADAM23O75077 832 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 NDUFS2O75306 463 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 GJB3O75712 270 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 CER1O95813 267 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 CYP2F1P24903 491 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 ANXA13P27216 316 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 ABCG1P45844 678 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 PPP3CCP48454 512 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 SLC7A9P82251 487 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 GRIK2Q13002 908 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 DHCR24Q15392 516 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 GAB4Q2WGN9 574 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 WDR45BQ5MNZ6 344 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 SLFN12LQ6IEE8 588 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 VSTM1Q6UX27 236 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 DTHD1Q6ZMT9 781 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 KCNK18Q7Z418 384 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 SCUBE3Q8IX30 993 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 GALNT15Q8N3T1 639 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 PDCL2Q8N4E4 241 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 FRMD1Q8N878 549 aa9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
HLA-B-257ENST00000640094 OR2I1PQ8NGU4 316 aa9.25□□□□□ -0.93
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