RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-222	ENST00000639501	MTBP	Q96DY7	904 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	CENPK	Q9BS16	269 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	ZWILCH	Q9H900	591 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	PARVA	Q9NVD7	372 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	ARHGAP8	P85298	464 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	BST1	Q10588	318 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	VCX3B	Q9H321	246 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	OR6B1	O95007	311 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	XKR9	Q5GH70	373 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	GPD1L	Q8N335	351 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	VNN1	O95497	513 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	IL1B	P01584	269 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	PDE1B	Q01064	536 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	LPCAT4	Q643R3	524 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	ACAD11	Q709F0	780 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	PDSS2	Q86YH6	399 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	ACAP3	Q96P50	834 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	PHF24	Q9UPV7	400 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	KBTBD13	C9JR72	458 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	CYB561D2	O14569	222 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	CREB3	O43889	395 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	ELK3	P41970	407 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	INHBC	P55103	352 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	BPIFB4	P59827	614 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	NAT14	Q8WUY8	206 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	21.39	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	21.39	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	21.39	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	SATL1	Q86VE3	508 aa		21.39	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	MASTL	Q96GX5	879 aa		21.39	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		21.39	■■□□□ 1.02
PMS1-222	ENST00000639501		A0A088AWK7	358 aa		21.39	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		21.39	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF862	O60290	1169 aa		21.39	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	OPHN1	O60890	802 aa		21.39	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	AQP5	P55064	265 aa		21.39	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	21.39	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	CUL2	Q13617	745 aa		21.39	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	21.39	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	AOC3	Q16853	763 aa		21.39	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		21.39	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	PCGF5	Q86SE9	256 aa		21.39	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	21.39	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	EBF4	Q9BQW3	602 aa		21.39	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		21.39	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	IDI2	Q9BXS1	227 aa		21.39	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	21.39	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	PDLIM1	O00151	329 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	KLF11	O14901	512 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	MMP8	P22894	467 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	CPOX	P36551	454 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	AQP4	P55087	323 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	21.38	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	ZACN	Q401N2	412 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	WDR44	Q5JSH3	913 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	RASSF3	Q86WH2	238 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	GPAM	Q9HCL2	828 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	PREB	Q9HCU5	417 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PMS1-222	ENST00000639501	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		21.38	■■□□□ 1.01

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