RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	SLCO2A1	Q92959	643 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF333	Q96JL9	665 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	KCND2	Q9NZV8	630 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482		E5RJQ4	531 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	PSMG1	O95456	288 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	CD48	P09326	243 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	CYP2C8	P10632	490 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	RFX6	Q8HWS3	928 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	TEX9	Q8N6V9	391 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	STRA6	Q9BX79	667 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	SPON1	Q9HCB6	807 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	CLUH	O75153	1309 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	PRKCE	Q02156	737 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	RASA2	Q15283	850 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	CDO1	Q16878	200 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	MON1B	Q7L1V2	547 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	EXD1	Q8NHP7	514 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	COPS5	Q92905	334 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	TTC25	Q96NG3	672 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	CSAD	Q9Y600	493 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC160	A6NGH7	325 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	C2CD2L	O14523	706 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	TYROBP	O43914	113 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	GJB1	P08034	283 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	PSMA2	P25787	234 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	PHB	P35232	272 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	NOMO3	P69849	1222 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	OGDH	Q02218	1023 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	PDIK1L	Q8N165	341 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	SERAC1	Q96JX3	654 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	IWS1	Q96ST2	819 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	SMAP	O00193	183 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	ELK3	P41970	407 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	INHBE	P58166	350 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	LMNB2	Q03252	620 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC34A1	Q06495	639 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	TAF5	Q15542	800 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	NPNT	Q6UXI9	565 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	ALLC	Q8N6M5	410 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	PSTPIP1	O43586	416 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	TCEA3	O75764	348 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	WFS1	O76024	890 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	TMEM63A	O94886	807 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	KRT19	P08727	400 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM81B	Q96LP2	452 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	PARVA	Q9NVD7	372 aa		10.49	□□□□□ -0.73

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms