RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635397.1

SMARCA2-241, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, humanhuman

TSL 4

Gene SMARCA2, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2-241ENST00000635397 POSTNQ15063 836 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 VPS53Q5VIR6 699 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 ICE2Q659A1 982 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 TRIM5Q9C035 493 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 SERTAD3Q9UJW9 196 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 MARCH11A6NNE9 402 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 K7ESM1 405 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 MUSKO15146 869 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 CSF1RP07333 972 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 HSD3B1P14060 373 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 NPPBP16860 134 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 GATA3P23771 443 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 MST1P26927 711 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 ADORA2AP29274 412 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 PRKAR1BP31321 381 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 VAV2P52735 878 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 PLP2Q04941 152 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 NFIXQ14938 502 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 TIGD6Q17RP2 521 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 FAM136AQ96C01 138 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 GCC1Q96CN9 775 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 FAM227BQ96M60 508 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 TMEM74BQ9NUR3 256 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 INTS13Q9NVM9 706 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.31□□□□□ -1.4
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SMARCA2-241ENST00000635397 USP1O94782 785 aa6.3□□□□□ -1.4
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SMARCA2-241ENST00000635397 SRGAP2BP0DMP2 458 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 HGFP14210 728 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC5A2P31639 672 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 PDE6CP51160 858 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 GPS1Q13098 491 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 CCNIQ14094 377 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 SULT6B1Q6IMI4 303 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
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SMARCA2-241ENST00000635397 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.3□□□□□ -1.4
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SMARCA2-241ENST00000635397 EID2BQ96D98 161 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 KATNAL1Q9BW62 490 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 KLC2Q9H0B6 622 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 CA14Q9ULX7 337 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 DTNAQ9Y4J8 743 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 M0R3H8 397 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 FCHO1O14526 889 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 ITGA2BP08514 1039 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 ARP10275 920 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 PGDP52209 483 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 POLE2P56282 527 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 POU5F1BQ06416 359 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 TAF5Q15542 800 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 DEPDC1Q5TB30 811 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.29□□□□□ -1.4
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SMARCA2-241ENST00000635397 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 PALM2Q8IXS6 379 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF276Q8N554 614 aa6.29□□□□□ -1.4
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SMARCA2-241ENST00000635397 PAF1Q8N7H5 531 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 ATRIPQ8WXE1 791 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 RUBCNQ92622 972 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 C8orf49Q96NF6 230 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 HELLSQ9NRZ9 838 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 PPM1DO15297 605 aa6.28□□□□□ -1.4
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