RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624927.3

LINC01128-215, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1128, human

TSL 5

Gene LINC01128, Length 677 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01128-215	ENST00000624927	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	USP45	Q70EL2	814 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	RGMA	Q96B86	450 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	COL6A3	P12111	3177 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	ELFN1	P0C7U0	828 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	TCF15	Q12870	199 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	KIF20A	O95235	890 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	POU2F2	P09086	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	VCAM1	P19320	739 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	PHKA1	P46020	1223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	USP37	Q86T82	979 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	CPA6	Q8N4T0	437 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	NELL2	Q99435	816 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	KIF1A	Q12756	1690 aa		4.96	□□□□□ -1.61
LINC01128-215	ENST00000624927	VPS4B	O75351	444 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	IL33	O95760	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	NR2F6	P10588	404 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	AKAP5	P24588	427 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	ITPKB	P27987	946 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	CD6	P30203	668 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	PGS1	Q32NB8	556 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
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LINC01128-215	ENST00000624927	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	RFK	Q969G6	155 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	CACNA1A	O00555	2505 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	NXPH3	O95157	252 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	PRKCG	P05129	697 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	RHO	P08100	348 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	TYR	P14679	529 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	PROK1	P58294	105 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	CCDC157	Q569K6	752 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01128-215	ENST00000624927	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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