RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620944.4

NME4-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NME4, Length 1,193 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-211ENST00000620944 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa23.11■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 KRT39Q6A163 491 aa23.11■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 TAS1R2Q8TE23 839 aa23.11■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 SLITRK1Q96PX8 696 aa23.11■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 CYP2S1Q96SQ9 504 aa23.11■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 SDCBP2Q9H190 292 aa23.11■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 SHISA7A6NL88 538 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 ABL1P00519 1130 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 SP9P0CG40 484 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 HDCP19113 662 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 ASPAP45381 313 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 PPP3CCP48454 512 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 NDST1P52848 882 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 USP46P62068 366 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 LRRC32Q14392 662 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 COBLL1Q53SF7 1204 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 TCERG1LQ5VWI1 586 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 FAM35AQ86V20 835 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 UNC93AQ86WB7 457 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 SMARCD1Q96GM5 515 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 TTLL2Q9BWV7 592 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 LMAN1LQ9HAT1 526 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 C2orf78A6NCI8 922 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 PSMA7O14818 248 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 CTHP32929 405 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 MXI1P50539 228 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 CACNA2D1P54289 1103 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 LRRC63Q05C16 580 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 ORC1Q13415 861 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 SPATA20Q8TB22 786 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 NIF3L1Q9GZT8 377 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 KRT82Q9NSB4 513 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 FBXO4Q9UKT5 387 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 R4GN57 208 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 AP1G2O75843 785 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 YWHAQP27348 245 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 TAF10Q12962 218 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 MTAPQ13126 283 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 PPP2R5DQ14738 602 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 MTF1Q14872 753 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 PDGFRLQ15198 375 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 ISM2Q6H9L7 571 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 ADSSL1Q8N142 457 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 NUP93Q8N1F7 819 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 SLC22A12Q96S37 553 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 IER2Q9BTL4 223 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 EBF3Q9H4W6 596 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 CYP3A43Q9HB55 503 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-211ENST00000620944 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 CCDC130P13994 396 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 PFKLP17858 780 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 CD58P19256 250 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 PPP1R2P41236 205 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 AMPD2Q01433 879 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 RUNX3Q13761 415 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 WDR44Q5JSH3 913 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 ANKRD40Q6AI12 368 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 TRIM68Q6AZZ1 485 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 FBXL13Q8NEE6 735 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 SLC2A14Q8TDB8 520 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 SH3RF2Q8TEC5 729 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 FBXO32Q969P5 355 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 KCNK16Q96T55 309 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 FAM83CQ9BQN1 747 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 NT5C1AQ9BXI3 368 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 CHRDQ9H2X0 955 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 FAM49BQ9NUQ9 324 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 TMEM30AQ9NV96 361 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 GCNT4Q9P109 453 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 HMGXB4Q9UGU5 601 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 ZNF840PA6NDX5 716 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 PRR23AA6NEV1 266 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 IFNAR2P48551 515 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 FZD5Q13467 585 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 PON2Q15165 354 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 ZNF77Q15935 545 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 ZNF528Q3MIS6 628 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 FUKQ8N0W3 1084 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 ZNF687Q8N1G0 1237 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 CRYBG2Q8N1P7 616 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 CPA6Q8N4T0 437 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 PDZD8Q8NEN9 1154 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 SEMA4AQ9H3S1 761 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 TRIM49BA6NDI0 452 aa23.05■■□□□ 1.28
NME4-211ENST00000620944 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms