RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TRAF2Q12933 501 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 LPIN1Q14693 890 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ATAD3BQ5T9A4 648 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CCDC81Q6ZN84 652 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 DDIASQ8IXT1 998 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CHST13Q8NET6 341 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TSPAN14Q8NG11 270 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ZFAND2BQ8WV99 257 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TRIM54Q9BYV2 358 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PRELID1Q9Y255 219 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 AFF2P51816 1311 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 GSG1L2A8MUP6 293 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 GUCY1B2O75343 617 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 DDHD2O94830 711 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 MYO1DO94832 1006 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 GYS1P13807 737 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 KCNA2P16389 499 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF12P17014 697 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CD58P19256 250 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 UBE3AQ05086 875 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 VEPH1Q14D04 833 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 XKR3Q5GH77 459 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TTC23LQ6PF05 361 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ARHGEF19Q8IW93 802 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 C19orf18Q8NEA5 215 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CKAP2Q8WWK9 683 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 WRNIP1Q96S55 665 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 RBBP8Q99708 897 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 EHD4Q9H223 541 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 C17orf75Q9HAS0 396 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 GIN1Q9NXP7 522 aa7.13□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 FCHO1O14526 889 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 RAD51BO15315 384 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TSC22D2O75157 780 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 BAIAP3O94812 1187 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CNTFP26441 200 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SPRP35270 261 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SARSP49591 514 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 BCAR1P56945 870 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PTENP60484 403 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TXNRD1Q16881 649 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 IMPG1Q17R60 797 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ANO4Q32M45 955 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM237Q96Q45 408 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 MED15Q96RN5 788 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ZSWIM1Q9BR11 485 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 NEUROG2Q9H2A3 272 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 FBXO28Q9NVF7 368 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CLIC5Q9NZA1 410 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 APEX2Q9UBZ4 518 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ALG6Q9Y672 507 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 MGRN1O60291 552 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TOMM70O94826 608 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ALADP13716 330 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 KCNJ2P63252 427 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CCDC142Q17RM4 750 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 LIN52Q52LA3 116 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CDKAL1Q5VV42 579 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 AKAP14Q86UN6 197 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SCAIQ8N9R8 606 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 DAGLBQ8NCG7 672 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PAK5Q9P286 719 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ITSN1Q15811 1721 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 DPPA5A6NC42 116 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 F5H6K3 240 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 APOL1O14791 398 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CSF1RP07333 972 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 AQP5P55064 265 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 KLRC3Q07444 240 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 KRT33BQ14525 404 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 QRICH1Q2TAL8 776 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF34Q8IZ26 560 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 KYQ8NBH2 561 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms