RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 NEUROG2Q9H2A3 272 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 EPHX3Q9H6B9 360 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 CWH43Q9H720 699 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 TNNC2P02585 160 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 CDC42EP1Q00587 391 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 ATF7IP2Q5U623 682 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 SPOPLQ6IQ16 392 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP26.84■■□□□ 1.89
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CAPNS1-204ENST00000587718 PARVAQ9NVD7 372 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHGC3Q9UN70 934 aa26.84■■□□□ 1.89
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CAPNS1-204ENST00000587718 PHKA2P46019 1235 aa26.83■■□□□ 1.89
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CAPNS1-204ENST00000587718 EP400NLQ6ZTU2 488 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 ECHDC2Q86YB7 292 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 RHOT1Q8IXI2 618 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 GRK7Q8WTQ7 553 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa26.83■■□□□ 1.89
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CAPNS1-204ENST00000587718 MMP8P22894 467 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 TRPC3Q13507 836 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 KATNAL2Q8IYT4 538 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 NLRP7Q8WX94 980 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF606Q8WXB4 792 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 CPA5Q8WXQ8 436 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM51Q9BSJ1 452 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 TSPYL1Q9H0U9 437 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 AAASQ9NRG9 546 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 IP6K2Q9UHH9 426 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0U1RQF3 1178 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 LINC01565O15544 149 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 THAP12O43422 761 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 RARAP10276 462 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 MCF2P10911 925 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 CETN2P41208 172 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 GJD3Q8N144 294 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM35BQ8NCS4 154 aa26.81■■□□□ 1.88
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CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM191BP0C7N4 346 aa26.8■■□□□ 1.88
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CAPNS1-204ENST00000587718 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLMAPQ14BN4 828 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 CEP85LQ5SZL2 805 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 RHPN2Q8IUC4 686 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 FEZF2Q8TBJ5 459 aa26.8■■□□□ 1.88
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CAPNS1-204ENST00000587718 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
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CAPNS1-204ENST00000587718 ECEL1O95672 775 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 TNFSF9P41273 254 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF568Q3ZCX4 644 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC31Q6UY01 552 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF410Q86VK4 478 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa26.8■■□□□ 1.88
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CAPNS1-204ENST00000587718 C18orf8Q96DM3 657 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 BTBD6Q96KE9 485 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 CHST12Q9NRB3 414 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 GRHL1Q9NZI5 618 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 WHRNQ9P202 907 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 COL9A1P20849 921 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 IRAK1P51617 712 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 CAV1Q03135 178 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 TTC27Q6P3X3 843 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 ZDHHC24Q6UX98 284 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB33Q86T24 672 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC105Q8IYK2 499 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM109Q9BVC6 243 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAIPQ9BWF2 469 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 MTMR12Q9C0I1 747 aa26.79■■□□□ 1.88
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