RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 PDPK1O15530 556 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 EXTL3O43909 919 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TSPAN3O60637 253 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SOCS5O75159 536 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 GOSR1O95249 250 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ADCY5O95622 1261 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 DDX58O95786 925 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CKBP12277 381 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ALAS1P13196 640 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ATP5JP18859 108 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SOX6P35712 828 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SLC16A2P36021 539 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 HAAOP46952 286 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 AK2P54819 239 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 RRADP55042 308 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP10-11P60412 298 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 GPR85P60893 370 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ACY1Q03154 408 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 PRKG1Q13976 671 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 NFE2L1Q14494 772 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 GBX1Q14549 363 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 GRM3Q14832 879 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CRYMQ14894 314 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SART3Q15020 963 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 STK11Q15831 433 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TPGS2Q68CL5 300 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 GPR139Q6DWJ6 353 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 KIAA1328Q86T90 577 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 OR52K1Q8NGK4 314 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 GAL3ST1Q99999 423 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 ACAD9Q9H845 621 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 CRLF2Q9HC73 371 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MAN1C1Q9NR34 630 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 FKBP14Q9NWM8 211 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MCM9Q9NXL9 1143 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SLC5A4Q9NY91 659 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 LRP2BPQ9P2M1 347 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D14Q9P2M4 693 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 RCAN3Q9UKA8 241 aa3.28□□□□□ -1.88
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