RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP46P62068 366 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYCP1Q15431 976 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGAP17Q68EM7 881 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 TFAP2BQ92481 460 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYO10Q9HD67 2058 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 OBSL1O75147 1896 aa22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTC28Q96AY4 2481 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 PATJQ8NI35 1801 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 TEAD2Q15562 447 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 SHC3Q92529 594 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYRFLQ96LU7 910 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 DUSP16Q9BY84 665 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 TEX33O43247 280 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 UCHL3P15374 230 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF445P59923 1031 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTPN21Q16825 1174 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM150AQ86TG1 271 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZSWIM1Q9BR11 485 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 MICAL2O94851 1124 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 FGF19O95750 216 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 SERPINC1P01008 464 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 F11P03951 625 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 NPR3P17342 541 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP4F8P98187 520 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUP93Q8N1F7 819 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZSWIM3Q96MP5 696 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 GANQ9H2C0 597 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 ACP6Q9NPH0 428 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 O00370 1275 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNFRSF10BO14763 440 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 EPHB6O15197 1021 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDC25CP30307 473 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTC30AQ86WT1 665 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNF135Q8IUD6 432 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNF214Q8ND24 703 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 HHLA1C9JL84 531 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 ASGR2P07307 311 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC5A3P53794 718 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 FANCCQ00597 558 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBA3Q8TBC4 463 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 GCNAQ96QF7 691 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPR88Q9GZN0 384 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 GDE1Q9NZC3 331 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 HESX1Q9UBX0 185 aa22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A1B0GTH6 734 aa22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP26A1O43174 497 aa22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 TADA3O75528 432 aa22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 CNGA2Q16280 664 aa22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPR158Q5T848 1215 aa22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 LCLAT1Q6UWP7 414 aa22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 MUC3AQ02505 3323 aa22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 RFX1P22670 979 aa22.14■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 GNA15P30679 374 aa22.14■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 TAF10Q12962 218 aa22.14■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.14■■□□□ 1.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 NEK11Q8NG66 645 aa22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms