RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	VGLL4	Q14135	290 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	TFDP2	Q14188	446 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	DPYSL3	Q14195	570 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	MSS51	Q4VC12	460 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM50	Q86XT4	487 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	TTC39C	Q8N584	583 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	EMC1	Q8N766	993 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA18	Q8TC71	538 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	AGAP11	Q8TF27	550 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	SPOCK2	Q92563	424 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	VPS11	Q9H270	941 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CHKB	Q9Y259	395 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ANK1	P16157	1881 aa		19.27	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ARIH2	O95376	493 aa		19.26	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	VDR	P11473	427 aa		19.26	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	19.26	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	19.26	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		19.26	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	BBS9	Q3SYG4	887 aa		19.26	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		19.26	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CEP120	Q8N960	986 aa		19.26	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	19.26	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA33	Q96N06	139 aa		19.26	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM237	Q96Q45	408 aa		19.26	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		19.26	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CALN1	Q9BXU9	219 aa		19.26	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	19.26	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	B4GALT5	O43286	388 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	MICAL2	O94851	1124 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CD48	P09326	243 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ELF1	P32519	619 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CDH8	P55286	799 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ROR1	Q01973	937 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	POU5F1B	Q06416	359 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	PRKG1	Q13976	671 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	KYAT1	Q16773	422 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	HSPH1	Q92598	858 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CNPY3	Q9BT09	278 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ASB7	Q9H672	318 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CSAD	Q9Y600	493 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	PTPRF	P10586	1907 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559		M0QYV0	167 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	PEX10	O60683	326 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	MCF2	P10911	925 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	PHKA2	P46019	1235 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	GAD2	Q05329	585 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	FAM187B	Q17R55	369 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	BANP	Q8N9N5	519 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	MZB1	Q8WU39	189 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	C10orf82	Q8WW14	230 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	SDCBP2	Q9H190	292 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CYLD	Q9NQC7	956 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		19.25	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	C2CD2L	O14523	706 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM63A	O94886	807 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ENDOD1	O94919	500 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ANP32D	O95626	131 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	ITGB3	P05106	788 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	NFIC	P08651	508 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	STAG3L1	P0CL83	205 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	GPD2	P43304	727 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	PSMC4	P43686	418 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CBLB	Q13191	982 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	LACTBL1	A8MY62	500 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	GPD1	P21695	349 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	NOMO1	Q15155	1222 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	GPATCH11	Q8N954	259 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		19.24	■□□□□ 0.67
RRN3-205	ENST00000563559	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		19.24	■□□□□ 0.67

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