RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.35■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.35■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PWWP2AQ96N64 755 aa22.35■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBCBQ99426 244 aa22.35■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LGALS13Q9UHV8 139 aa22.35■■□□□ 1.17
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
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