RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 DDI1Q8WTU0 396 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 RUBCNQ92622 972 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 GTF3C6Q969F1 213 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 C19orf60Q96EN9 201 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 NLRP4Q96MN2 994 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 HHIPQ96QV1 700 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 PPP1R16BQ96T49 567 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 MNTQ99583 582 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 MENTQ9BUN1 341 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 OR10A4Q9H209 315 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 C1orf21Q9H246 121 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 KCNF1Q9H3M0 494 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 HAUS4Q9H6D7 363 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 GORASP2Q9H8Y8 452 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 ARFGAP3Q9NP61 516 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 ADPRHL2Q9NX46 363 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 ACTR10Q9NZ32 417 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 ZSWIM5Q9P217 1185 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CDC23Q9UJX2 597 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 USP54Q70EL1 1684 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC78A2IDD5 438 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 GOLGA8MH3BSY2 632 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 TPP1O14773 563 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 IRAK2O43187 625 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CHGBP05060 677 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 FESP07332 822 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 FAM153BP0C7A2 387 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 DHRS4L1P0CG22 281 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 PRKAR1AP10644 381 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 ALADP13716 330 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 PCSK2P16519 638 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CDC25CP30307 473 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 MC4RP32245 332 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 OR1G1P47890 313 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CACNB3P54284 484 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CABP4P57796 275 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 TMPRSS15P98073 1019 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CUL1Q13616 776 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 AUHQ13825 339 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 COTL1Q14019 142 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 GALNT3Q14435 633 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 KRT32Q14532 448 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF124Q15973 351 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CNGA2Q16280 664 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 AAK1Q2M2I8 961 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 TMTC4Q5T4D3 741 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 HGSNATQ68CP4 663 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 NEPROQ6NW34 567 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 SYT10Q6XYQ8 523 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 TTLL7Q6ZT98 887 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 GATAD2AQ86YP4 633 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 SLC22A9Q8IVM8 553 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 TTC5Q8N0Z6 440 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 MFSD2AQ8NA29 543 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 OR6S1Q8NH40 331 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 WASF1Q92558 559 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 KRT35Q92764 455 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 PTP4A1Q93096 173 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 TBCBQ99426 244 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 ADAM19Q9H013 955 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 C7orf69Q9H7B7 122 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 KIF9Q9HAQ2 790 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 SERINC1Q9NRX5 453 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 TAS2R3Q9NYW6 316 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 HMG20BQ9P0W2 317 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 ACTR3BQ9P1U1 418 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 IL19Q9UHD0 177 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 PSME2Q9UL46 239 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 PYCARDQ9ULZ3 195 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 ELP1O95163 1332 aa5.79□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 LRRD1A4D1F6 860 aa5.79□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM247A6NEH6 219 aa5.79□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 TARM1B6A8C7 271 aa5.79□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 NDUFS8O00217 210 aa5.79□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 NFKBIEO00221 500 aa5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms