RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559494.1

TSPAN3-207, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN3, Length 1,326 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-207ENST00000559494 CD19P15391 556 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 MAP3K7CLP57077 242 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 USP46P62068 366 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 UBXN1Q04323 297 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 SGO2Q562F6 1265 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 CLEC20AQ6ZU45 233 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 TMEM150AQ86TG1 271 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 NPAS3Q8IXF0 933 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 PLCD3Q8N3E9 789 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 SHC3Q92529 594 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 MCRS1Q96EZ8 462 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 ZSWIM1Q9BR11 485 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 EPS15L1Q9UBC2 864 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 TNFRSF10BO14763 440 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 TEX33O43247 280 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 FAM200BP0CF97 657 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 KRT5P13647 590 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 TEAD2Q15562 447 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 DUSP16Q9BY84 665 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 HHLA1C9JL84 531 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 FGF19O95750 216 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 UCHL3P15374 230 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 ZNF445P59923 1031 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 SYCP1Q15431 976 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 RNF135Q8IUD6 432 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 NUP93Q8N1F7 819 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 ANKRD52Q8NB46 1076 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 ZSWIM3Q96MP5 696 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 ERGIC2Q96RQ1 377 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 TTLL2Q9BWV7 592 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 GANQ9H2C0 597 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 ATXN3LQ9H3M9 355 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 O00370 1275 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 NPR3P17342 541 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 BRD2P25440 801 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 TTC30AQ86WT1 665 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 SCAMP5Q8TAC9 235 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 GPR88Q9GZN0 384 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 ACP6Q9NPH0 428 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 GDE1Q9NZC3 331 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 IL37Q9NZH6 218 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 TSPAN16Q9UKR8 245 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 DENND4CQ5VZ89 1909 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 A0A1B0GTH6 734 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 EPHB6O15197 1021 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 TADA3O75528 432 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 CDC25CP30307 473 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 USP8P40818 1118 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 TPM4P67936 248 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 CYP4F8P98187 520 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 CNGA2Q16280 664 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 STXBP5Q5T5C0 1151 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-207ENST00000559494 CUL9Q8IWT3 2517 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 CYP26A1O43174 497 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 ASGR2P07307 311 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 CLCN1P35523 988 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 SLC5A3P53794 718 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 FANCCQ00597 558 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 RAPGEF1Q13905 1077 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 PTPN21Q16825 1174 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 PKDCCQ504Y2 493 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 GPR158Q5T848 1215 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 SMYD5Q6GMV2 418 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 UBA3Q8TBC4 463 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 STK33Q9BYT3 514 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 ANHXE9PGG2 379 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 TULP2O00295 520 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 SERPINC1P01008 464 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 YWHAQP27348 245 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 PDE4CQ08493 712 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 TAF10Q12962 218 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-207ENST00000559494 NR1I3Q14994 352 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms