RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558714.5

TMOD3-205, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-205ENST00000558714 SLC25A32Q9H2D1 315 aa3.54□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 FAM83DQ9H4H8 585 aa3.54□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 RRN3Q9NYV6 651 aa3.54□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa3.54□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 RNF181Q9P0P0 153 aa3.54□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 HPSEQ9Y251 543 aa3.54□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 TESMINQ9Y4I5 508 aa3.54□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 HS3ST4Q9Y661 456 aa3.54□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 AHRRA9YTQ3 701 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 MATN3O15232 486 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 NCAM2O15394 837 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
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TMOD3-205ENST00000558714 CFIP05156 583 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 CSF1RP07333 972 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 ARP10275 920 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 CD53P19397 219 aa3.53□□□□□ -1.84
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TMOD3-205ENST00000558714 NPTX2P47972 431 aa3.53□□□□□ -1.84
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TMOD3-205ENST00000558714 FAM189BP81408 668 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 GPS1Q13098 491 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 RALBP1Q15311 655 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 TAF5Q15542 800 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 TIGD6Q17RP2 521 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 GEN1Q17RS7 908 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 ARHGAP40Q5TG30 622 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 MANEALQ5VSG8 457 aa3.53□□□□□ -1.84
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TMOD3-205ENST00000558714 MZT2AQ6P582 158 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 FOXR2Q6PJQ5 311 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 CLNKQ7Z7G1 428 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 FAM109AQ8N4B1 249 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 OR1N1Q8NGS0 311 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 TMEM125Q96AQ2 219 aa3.53□□□□□ -1.84
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TMOD3-205ENST00000558714 ITM2CQ9NQX7 267 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
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TMOD3-205ENST00000558714 VPS51Q9UID3 782 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 CA14Q9ULX7 337 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 SORCS3Q9UPU3 1222 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 DTNAQ9Y4J8 743 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-205ENST00000558714 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa3.53□□□□□ -1.84
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TMOD3-205ENST00000558714 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa3.52□□□□□ -1.85
TMOD3-205ENST00000558714 OR2W5A6NFC9 320 aa3.52□□□□□ -1.85
TMOD3-205ENST00000558714 FCHO1O14526 889 aa3.52□□□□□ -1.85
TMOD3-205ENST00000558714 MUSKO15146 869 aa3.52□□□□□ -1.85
TMOD3-205ENST00000558714 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
TMOD3-205ENST00000558714 USP1O94782 785 aa3.52□□□□□ -1.85
TMOD3-205ENST00000558714 ITGA2BP08514 1039 aa3.52□□□□□ -1.85
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TMOD3-205ENST00000558714 ACRV1P26436 265 aa3.52□□□□□ -1.85
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TMOD3-205ENST00000558714 PNLIPRP1P54315 467 aa3.52□□□□□ -1.85
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TMOD3-205ENST00000558714 CYP2A13Q16696 494 aa3.52□□□□□ -1.85
TMOD3-205ENST00000558714 PTCHD3Q3KNS1 767 aa3.52□□□□□ -1.85
TMOD3-205ENST00000558714 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
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TMOD3-205ENST00000558714 VPS53Q5VIR6 699 aa3.52□□□□□ -1.85
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TMOD3-205ENST00000558714 ZNF585AQ6P3V2 769 aa3.52□□□□□ -1.85
TMOD3-205ENST00000558714 LVRNQ6Q4G3 990 aa3.52□□□□□ -1.85
TMOD3-205ENST00000558714 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa3.52□□□□□ -1.85
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TMOD3-205ENST00000558714 SPARTQ8N0X7 666 aa3.52□□□□□ -1.85
TMOD3-205ENST00000558714 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa3.52□□□□□ -1.85
TMOD3-205ENST00000558714 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP3.52□□□□□ -1.85
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