RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 METTL23Q86XA0 190 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 SCUBE3Q8IX30 993 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 EMC1Q8N766 993 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 URGCPQ8TCY9 931 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 RXFP2Q8WXD0 754 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 APBB2Q92870 758 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 SLCO2A1Q92959 643 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 TOX2Q96NM4 488 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 SYT15Q9BQS2 421 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 ACBD6Q9BR61 282 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 B3GNT5Q9BYG0 378 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 OSBPL8Q9BZF1 889 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 RAB17Q9H0T7 212 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 VIPAS39Q9H9C1 493 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 FAM114A2Q9NRY5 505 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 TTI1O43156 1089 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 RRP9O43818 475 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 SASH3O75995 380 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 MYBL2P10244 700 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 RALAP11233 206 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 TCF4P15884 667 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 NPR3P17342 541 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 TKTP29401 623 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 PTPN9P43378 593 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 CARSP49589 748 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 EPHB4P54760 987 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 DR1Q01658 176 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 CASP8Q14790 479 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 TAZQ16635 292 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 CCDC14Q49A88 953 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 BOLA3Q53S33 107 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 EFHC1Q5JVL4 640 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 CLLU1OSQ5K130 101 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 C1orf53Q5VUE5 145 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 DUPD1Q68J44 220 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 FAM171BQ6P995 826 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 PIGZQ86VD9 579 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 THEM5Q8N1Q8 247 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 DBF4BQ8NFT6 615 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 RSPH1Q8WYR4 309 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 CAVIN3Q969G5 261 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 SUSD3Q96L08 255 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 SLITRK1Q96PX8 696 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 HINFPQ9BQA5 517 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 PAAF1Q9BRP4 392 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 ERP44Q9BS26 406 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 CRTAC1Q9NQ79 661 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 CACNG4Q9UBN1 327 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 RASAL2Q9UJF2 1139 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 PCDHB8Q9UN66 801 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 CITO14578 2027 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 MYBPHLA2RUH7 354 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 DCDC2CA8MYV0 355 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 DDHD2O94830 711 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 ENDOD1O94919 500 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 TJP3O95049 919 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 CXCL10P02778 98 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 KRT1P04264 644 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 FAM200BP0CF97 657 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 KDELR1P24390 212 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 IL1R2P27930 398 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 MIPP30301 263 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 GBP1P32455 592 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 FLT3P36888 993 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 BRCC3P46736 316 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 MDH1BQ5I0G3 518 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 TRNP1Q6NT89 227 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 TTC27Q6P3X3 843 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 MFSD7Q6UXD7 560 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 JAMLQ86YT9 394 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 CCDC50Q8IVM0 306 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 COLGALT2Q8IYK4 626 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 ATL2Q8NHH9 583 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 IFT81Q8WYA0 676 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 RAPGEF5Q92565 580 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 RTP3Q9BQQ7 232 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 HERPUD2Q9BSE4 406 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-209ENST00000547449 DCLK3Q9C098 648 aa10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms