RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM170BA6NMN3 283 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC38A8A6NNN8 435 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 HEPACAM2A8MVW5 462 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PMM2O15305 246 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 LAMTOR5O43504 91 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 AKAP3O75969 853 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 NOL4O94818 638 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 NFATC1O95644 943 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ABL1P00519 1130 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ASS1P00966 412 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CST3P01034 146 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 HLA-DRAP01903 254 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CKMP06732 381 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM200BP0CF97 657 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 RALAP11233 206 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 HDCP19113 662 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PRCPP42785 496 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 GCLMP48507 274 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 IFNAR2P48551 515 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PSEN1P49768 467 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TUBP50607 506 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 NLRP12P59046 1061 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 FCHO2Q0JRZ9 810 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PAK1Q13153 545 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 STILQ15468 1287 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC5A9Q2M3M2 681 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXO43Q4G163 708 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TANGO2Q6ICL3 276 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TPRG1Q6ZUI0 275 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 GAREM2Q75VX8 874 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRTM3Q86VH5 581 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 MON1AQ86VX9 555 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 C1orf210Q8IVY1 113 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC105Q8IYK2 499 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CRYBG2Q8N1P7 616 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CPA6Q8N4T0 437 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 MAB21L3Q8N8X9 362 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 MLKLQ8NB16 471 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 DTWD2Q8NBA8 298 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 GLIS3Q8NEA6 775 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ENGASEQ8NFI3 743 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CXorf38Q8TB03 319 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SPATA20Q8TB22 786 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SHKBP1Q8TBC3 707 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 GIPC2Q8TF65 315 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ATRIPQ8WXE1 791 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 RSAD2Q8WXG1 361 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM3CQ92520 227 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLGA1Q92805 767 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXO32Q969P5 355 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 MYLPFQ96A32 169 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 OTUB2Q96DC9 234 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TCEAL4Q96EI5 215 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 LPIN3Q9BQK8 851 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM62Q9BVG3 475 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 DNAJC25Q9H1X3 360 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 IKZF4Q9H2S9 585 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TRPC7Q9HCX4 862 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PNPLA8Q9NP80 782 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB20Q9NX57 234 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 VWA8A3KMH1 1905 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 MYBPHLA2RUH7 354 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 F8VP50 259 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 NARSO43776 548 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 AP1G2O75843 785 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PRR29P0C7W0 189 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ATF6P18850 670 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PTMSP20962 102 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 LMO2P25791 158 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CCR3P51677 355 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 NDST1P52848 882 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 GRM2Q14416 872 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ANGPT1Q15389 498 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 DDR2Q16832 855 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF528Q3MIS6 628 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 HECTD3Q5T447 861 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 BTBD8Q5XKL5 378 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 KLHL10Q6JEL2 608 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TMC8Q8IU68 726 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 HS6ST3Q8IZP7 471 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PJA1Q8NG27 643 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 NELFBQ8WX92 580 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 RUBCNQ92622 972 aa5.94□□□□□ -1.46
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