RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 OTOP3Q7RTS5 596 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 VCPKMTQ9H867 229 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 CHMP5Q9NZZ3 219 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TMX2Q9Y320 296 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 ARVCFO00192 962 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 CPLX1O14810 134 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 MATN3O15232 486 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 CD4P01730 458 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 GNAI2P04899 355 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 ASGR1P07306 291 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 FGFR1P11362 822 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 GRK2P25098 689 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 CYP2C18P33260 490 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 GRK3P35626 688 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 USP8P40818 1118 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 NTRK3Q16288 839 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TMEM31Q5JXX7 168 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 SFMBT2Q5VUG0 894 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 GLB1LQ6UWU2 654 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 PACS1Q6VY07 963 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 DTX3Q8N9I9 347 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 APPL2Q8NEU8 664 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 REPS2Q8NFH8 660 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 MYRIPQ8NFW9 859 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 ARHGAP45Q92619 1136 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 OSBP2Q969R2 916 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 SCLT1Q96NL6 688 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 SPAG5Q96R06 1193 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 SH2D4AQ9H788 454 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 FBXO28Q9NVF7 368 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 FAM184BQ9ULE4 1060 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TET1Q8NFU7 2136 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 UMODL1Q5DID0 1318 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 VWA5AO00534 786 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TBX3O15119 743 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 FGBP02675 491 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 MYOGP15173 224 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 STAT3P40763 770 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 MNAT1P51948 309 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 RABGGTBP53611 331 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TERF2Q15554 542 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 OTOP2Q7RTS6 562 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 FAM114A1Q8IWE2 563 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 ERMNQ8TAM6 284 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 DCAF4Q8WV16 495 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 CLEC4DQ8WXI8 215 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 JAKMIP2Q96AA8 810 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 NEK1Q96PY6 1258 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 KMT5AQ9NQR1 393 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TOMM22Q9NS69 142 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 SQORQ9Y6N5 450 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TRIOO75962 3097 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 SIP14410 1827 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 ZNF318Q5VUA4 2279 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 AKR1B1P15121 316 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 HSD3B2P26439 372 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 MYBPC3Q14896 1274 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 KIZQ2M2Z5 673 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 KCNT2Q6UVM3 1135 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 KLHL36Q8N4N3 616 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 GOLGA5Q8TBA6 731 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TEKT4Q8WW24 435 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 HIPK3Q9H422 1215 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 MCM9Q9NXL9 1143 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 FTSJ1Q9UET6 329 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms