RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-205ENST00000519846 ZNF700Q9H0M5 742 aa5.28□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 NLRC4Q9NPP4 1024 aa5.28□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 RAB20Q9NX57 234 aa5.28□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 GCNT4Q9P109 453 aa5.28□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 TMEM63CQ9P1W3 806 aa5.28□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
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CLVS1-205ENST00000519846 KNL1Q8NG31 2342 aa5.28□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa5.28□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa5.28□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
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CLVS1-205ENST00000519846 NDUFB5O43674 189 aa5.28□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
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CLVS1-205ENST00000519846 RAB33AQ14088 237 aa5.28□□□□□ -1.56
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CLVS1-205ENST00000519846 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 LRRTM3Q86VH5 581 aa5.28□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 MAB21L3Q8N8X9 362 aa5.28□□□□□ -1.56
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CLVS1-205ENST00000519846 TMEM8AQ9HCN3 771 aa5.28□□□□□ -1.56
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CLVS1-205ENST00000519846 COX16Q9P0S2 106 aa5.28□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 STK39Q9UEW8 545 aa5.28□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 CA14Q9ULX7 337 aa5.28□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa5.28□□□□□ -1.56
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CLVS1-205ENST00000519846 FAM189A1O60320 539 aa5.27□□□□□ -1.57
CLVS1-205ENST00000519846 ATF2P15336 505 aa5.27□□□□□ -1.57
CLVS1-205ENST00000519846 TYMPP19971 482 aa5.27□□□□□ -1.57
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CLVS1-205ENST00000519846 CBWD5Q5RIA9 395 aa5.27□□□□□ -1.57
CLVS1-205ENST00000519846 TAF3Q5VWG9 929 aa5.27□□□□□ -1.57
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CLVS1-205ENST00000519846 KAT5Q92993 513 aa5.27□□□□□ -1.57
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CLVS1-205ENST00000519846 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CLVS1-205ENST00000519846 CD300LGQ6UXG3 332 aa5.27□□□□□ -1.57
CLVS1-205ENST00000519846 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa5.27□□□□□ -1.57
CLVS1-205ENST00000519846 PASD1Q8IV76 773 aa5.27□□□□□ -1.57
CLVS1-205ENST00000519846 TMEM86AQ8N2M4 240 aa5.27□□□□□ -1.57
CLVS1-205ENST00000519846 TRIML1Q8N9V2 468 aa5.27□□□□□ -1.57
CLVS1-205ENST00000519846 SMRP1Q8NCR6 262 aa5.27□□□□□ -1.57
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