RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517329.1

TNIP1-203, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNIP1, Length 645 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1-203ENST00000517329 EPB41P11171 864 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 GTF2H1P32780 548 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 CTHP32929 405 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 PRCPP42785 496 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 PPP3CCP48454 512 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 USP46P62068 366 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 PPP3CAQ08209 521 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 MTAPQ13126 283 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 LRRC32Q14392 662 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 ZNF528Q3MIS6 628 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 COBLL1Q53SF7 1204 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 SPOPLQ6IQ16 392 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 ASCL5Q7RTU5 278 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 ACOT1Q86TX2 421 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 UNC93AQ86WB7 457 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 CCDC150Q8NCX0 1101 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 TSG101Q99816 390 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 FAM83CQ9BQN1 747 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 CHRDQ9H2X0 955 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 SEMA4AQ9H3S1 761 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 MMRN2Q9H8L6 949 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 TMEM8AQ9HCN3 771 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 R4GN57 208 aa15.98■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 C2orf78A6NCI8 922 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 STX10O60499 249 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 KINO60870 393 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 PFKLP17858 780 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 HDCP19113 662 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 ASPAP45381 313 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 NDST1P52848 882 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 CACNA2D1P54289 1103 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 PDGFRLQ15198 375 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 FAM35AQ86V20 835 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 NUP93Q8N1F7 819 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 TTC16Q8NEE8 873 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 SPATA20Q8TB22 786 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 TAS1R2Q8TE23 839 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 EEF2KMTQ96G04 330 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 SLITRK1Q96PX8 696 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 SLC22A12Q96S37 553 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 TMEM30AQ9NV96 361 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 GCNT4Q9P109 453 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 MYO15AQ9UKN7 3530 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 DENND4CQ5VZ89 1909 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 USP34Q70CQ2 3546 aa15.97■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 PTPRDP23468 1912 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 ZNF840PA6NDX5 716 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 ABL1P00519 1130 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 CHRNB1P11230 501 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 TAF10Q12962 218 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 STIM1Q13586 685 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 RUNX3Q13761 415 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 PPP2R5DQ14738 602 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 MTF1Q14872 753 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 DGKKQ5KSL6 1271 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 KRT39Q6A163 491 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 TRIM68Q6AZZ1 485 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 TXNDC11Q6PKC3 985 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 CRYBG2Q8N1P7 616 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 RIN3Q8TB24 985 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 SMARCD1Q96GM5 515 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 DNAI2Q9GZS0 605 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 NIF3L1Q9GZT8 377 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 EBF3Q9H4W6 596 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 CYP3A43Q9HB55 503 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 HPS4Q9NQG7 708 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 OBSL1O75147 1896 aa15.96■□□□□ 0.15
TNIP1-203ENST00000517329 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TNIP1-203ENST00000517329 AP1G2O75843 785 aa15.95■□□□□ 0.14
TNIP1-203ENST00000517329 YWHAQP27348 245 aa15.95■□□□□ 0.14
TNIP1-203ENST00000517329 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TNIP1-203ENST00000517329 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TNIP1-203ENST00000517329 AMPD2Q01433 879 aa15.95■□□□□ 0.14
TNIP1-203ENST00000517329 USP4Q13107 963 aa15.95■□□□□ 0.14
TNIP1-203ENST00000517329 ORC1Q13415 861 aa15.95■□□□□ 0.14
TNIP1-203ENST00000517329 PON2Q15165 354 aa15.95■□□□□ 0.14
TNIP1-203ENST00000517329 ZNF77Q15935 545 aa15.95■□□□□ 0.14
TNIP1-203ENST00000517329 ANKRD40Q6AI12 368 aa15.95■□□□□ 0.14
TNIP1-203ENST00000517329 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.95■□□□□ 0.14
TNIP1-203ENST00000517329 PAQR9Q6ZVX9 377 aa15.95■□□□□ 0.14
TNIP1-203ENST00000517329 FUKQ8N0W3 1084 aa15.95■□□□□ 0.14
TNIP1-203ENST00000517329 ADSSL1Q8N142 457 aa15.95■□□□□ 0.14
TNIP1-203ENST00000517329 PDZD8Q8NEN9 1154 aa15.95■□□□□ 0.14
TNIP1-203ENST00000517329 SLC2A14Q8TDB8 520 aa15.95■□□□□ 0.14
TNIP1-203ENST00000517329 SH3RF2Q8TEC5 729 aa15.95■□□□□ 0.14
TNIP1-203ENST00000517329 KCNK16Q96T55 309 aa15.95■□□□□ 0.14
TNIP1-203ENST00000517329 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TNIP1-203ENST00000517329 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TNIP1-203ENST00000517329 KRT82Q9NSB4 513 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms