RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516876.1

RNU6-928P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 928, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-928P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-928P-201ENST00000516876 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 FITM2Q8N6M3 262 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 FSIP1Q8NA03 581 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM46DQ8NEK8 389 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 FLCNQ8NFG4 579 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZFP28Q8NHY6 868 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 ETNPPLQ8TBG4 499 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 CPT1CQ8TCG5 803 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 AFAP1L1Q8TED9 768 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 TBC1D5Q92609 795 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 SH3KBP1Q96B97 665 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 ASB2Q96Q27 587 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLF1Q9BQI6 1058 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 MESP1Q9BRJ9 268 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 RNF32Q9H0A6 362 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 VPS16Q9H269 839 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 EPC1Q9H2F5 836 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRDM13Q9H4Q3 707 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 BCAS3Q9H6U6 928 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZWILCHQ9H900 591 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 TPSG1Q9NRR2 321 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 TBC1D14Q9P2M4 693 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 DNAJB11Q9UBS4 358 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 SNX8Q9Y5X2 465 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 CDY1Q9Y6F8 540 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 PMS2P1A4D2B8 440 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 VWA3AA6NCI4 1184 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 C2orf78A6NCI8 922 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 BTBD11A6QL63 1104 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMEM232C9JQI7 657 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 H7C4K7 107 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PCDH17O14917 1159 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CLGNO14967 610 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 KIAA0355O15063 1070 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SPTLC2O15270 562 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 WIPF1O43516 503 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 RRP9O43818 475 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 AHCYL1O43865 530 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PTP4A3O75365 173 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TULP3O75386 442 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 EFEMP2O95967 443 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 DNTTP04053 509 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PROCP04070 461 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 LAMP2P13473 410 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 JUPP14923 745 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TGM1P22735 817 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 MGAT1P26572 445 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 MLH1P40692 756 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SEC24CP53992 1094 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 BPIFB4P59827 614 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ADAM17P78536 824 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PLIN5Q00G26 463 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 GOLGA8FQ08AF8 430 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 EPS8Q12929 822 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CDC16Q13042 620 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 DCTN1Q14203 1278 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 UBXN2BQ14CS0 331 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PCOLCEQ15113 449 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF750Q32MQ0 723 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF568Q3ZCX4 644 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 LIPMQ5VYY2 423 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 GPR139Q6DWJ6 353 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 MFSD5Q6N075 450 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZDHHC24Q6UX98 284 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 RASGRP2Q7LDG7 609 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 FRMD5Q7Z6J6 570 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 NBPF11Q86T75 865 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TAGAPQ8N103 731 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 LINC00482Q8N8I6 264 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CCDC191Q8NCU4 936 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 NFKBIDQ8NI38 313 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 HMGB4Q8WW32 186 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 JAKMIP2Q96AA8 810 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 APOPT1Q96IL0 206 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 NELL2Q99435 816 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SMOQ99835 787 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 FUZQ9BT04 418 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TXLNGYQ9BZA5 131 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 IMPG2Q9BZV3 1241 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 GSTO2Q9H4Y5 243 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 RETREG1Q9H6L5 497 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 EPS8L2Q9H6S3 715 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 L2HGDHQ9H9P8 463 aa3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms