RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 PNPOQ9NVS9 261 aa3.63□□□□□ -1.83
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RNU6-277P-201ENST00000516272 HDCP19113 662 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 GUCY2FP51841 1108 aa3.62□□□□□ -1.83
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RNU6-277P-201ENST00000516272 PHKG2P15735 406 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 UCP3P55916 312 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
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