RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 LTBRP36941 435 aa6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 ETFBP38117 255 aa6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 PPP1R2P41236 205 aa6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 APBA1Q02410 837 aa6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 ITIH3Q06033 890 aa6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 SOWAHAQ2M3V2 549 aa6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 TXNDC8Q6A555 127 aa6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 GJB7Q6PEY0 223 aa6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 ITIH5Q86UX2 942 aa6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 VN1R2Q8NFZ6 395 aa6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF516Q92618 1163 aa6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 CYP2S1Q96SQ9 504 aa6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 NAGPAQ9UK23 515 aa6.94□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 MYH11P35749 1972 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 KCNJ18B7U540 433 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 HDCP19113 662 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 CLCN4P51793 760 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 KCNJ12Q14500 433 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 TEAD2Q15562 447 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 GBP6Q6ZN66 633 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 GOLGA1Q92805 767 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 KCNK16Q96T55 309 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 CLEC1BQ9P126 229 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 MTRRQ9UBK8 725 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 SIX4Q9UIU6 781 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 NR2E1Q9Y466 385 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 TMCO5BA8MYB1 307 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 GDI1P31150 447 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 SSR1P43307 286 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 CBWD6Q4V339 395 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 CBWD3Q5JTY5 395 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 CBWD5Q5RIA9 395 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 LUZP1Q86V48 1076 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 FGF13Q92913 245 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 ZFP14Q9HCL3 533 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 STK39Q9UEW8 545 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 CEP83Q9Y592 693 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 UBE4BO95155 1302 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM186AA6NE01 2351 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 FRMPD3Q5JV73 1810 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 ATG2BQ96BY7 2078 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 MTMR11A4FU01 709 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 C2CD4DB7Z1M9 353 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 M0QYV0 167 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 TNFRSF10BO14763 440 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM200BP0CF97 657 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 CYP3A5P20815 502 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 FGFR3P22607 806 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 FMO5P49326 533 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 AP3M2P53677 418 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 RAB33AQ14088 237 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.93□□□□□ -1.3
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RRN3P1-201ENST00000514813 OSTM1Q86WC4 334 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 PGBD3Q8N328 593 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 KAT5Q92993 513 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 PCED1BQ96HM7 432 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 NECTIN4Q96NY8 510 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 CHST7Q9NS84 486 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 CISHQ9NSE2 258 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.93□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP8B3O60423 1300 aa6.92□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.92□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 PIRO00625 290 aa6.92□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF197O14709 1029 aa6.92□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 GNA14O95837 355 aa6.92□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC9A1P19634 815 aa6.92□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 MYL5Q02045 173 aa6.92□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.92□□□□□ -1.3
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