RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	DPYSL4	O14531	572 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	TNFRSF10B	O14763	440 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM66	O15016	1216 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMC2	O95347	1197 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHRNB1	P11230	501 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCNE1	P24864	410 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDST1	P52848	882 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	INCA1	Q0VD86	236 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	GAS6	Q14393	721 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF77	Q15935	545 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACOT1	Q86TX2	421 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM35A	Q86V20	835 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	YAF2	Q8IY57	180 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTC8	Q8TAM2	541 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	WHAMM	Q8TF30	809 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNK16	Q96T55	309 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	NELL2	Q99435	816 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	TDP1	Q9NUW8	608 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL37	Q9NZH6	218 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAN2B1	O00754	1011 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CETN3	O15182	167 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	BEST1	O76090	585 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	SP9	P0CG40	484 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT13	P13646	458 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC130	P13994	396 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	GTF2H1	P32780	548 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTH	P32929	405 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	AVPR1A	P37288	418 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	USP4	Q13107	963 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CBWD6	Q4V339	395 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	ISM2	Q6H9L7	571 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	UNC93A	Q86WB7	457 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	C12orf29	Q8N999	325 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM3C	Q92520	227 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMO	Q99835	787 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHRD	Q9H2X0	955 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	GKN1	Q9NS71	199 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM92A	A1XBS5	289 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	OLFM2	O95897	454 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	TDGF1	P13385	188 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	P4HA1	P13674	534 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARSA	P15289	507 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCF3	P15923	654 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANXA13	P27216	316 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAGEA9	P43362	315 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	PGF	P49763	221 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLCB2	Q00722	1185 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAF10	Q12962	218 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTAP	Q13126	283 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	MORC3	Q14149	939 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT39	Q6A163	491 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	TNIP3	Q96KP6	325 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF38	Q9H0F5	515 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM186A	A6NE01	2351 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRR23A	A6NEV1	266 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	HHLA1	C9JL84	531 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CILP	O75339	1184 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	USP17L7	P0C7H9	530 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	MXI1	P50539	228 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC63	Q05C16	580 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTF1	Q14872	753 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTI2	Q6NXR4	508 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		13.49	□□□□□ -0.25

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