RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 SPARTQ8N0X7 666 aa5.11□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 MYCT1Q8N699 235 aa5.11□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.11□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 EXTL1Q92935 676 aa5.11□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 C18orf8Q96DM3 657 aa5.11□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 SCLT1Q96NL6 688 aa5.11□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 HERPUD2Q9BSE4 406 aa5.11□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 SLC46A2Q9BY10 475 aa5.11□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 AS3MTQ9HBK9 375 aa5.11□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 GALNT9Q9HCQ5 603 aa5.11□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa5.11□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 LRFN1Q9P244 771 aa5.11□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa5.11□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa5.11□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 A0A0B4J269 797 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 UNC119BA6NIH7 251 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 CLCA1A8K7I4 914 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 E7ENX8 843 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 ABCA8O94911 1581 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 YY1P25490 414 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 TAP2Q03519 686 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 EFEMP1Q12805 493 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 MYO1EQ12965 1108 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 TUBB3Q13509 450 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 BLMHQ13867 455 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 E2F2Q14209 437 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 KRT72Q14CN4 511 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 CYP2A13Q16696 494 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 CRTC1Q6UUV9 634 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 LRRC55Q6ZSA7 311 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 USP49Q70CQ1 688 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF276Q8N554 614 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 VGLL2Q8N8G2 317 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 Q8NA96 180 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 GLIS1Q8NBF1 620 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 SNX27Q96L92 541 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 PTDSS2Q9BVG9 487 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 STK33Q9BYT3 514 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 TPSD1Q9BZJ3 242 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 OBP2BQ9NPH6 170 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 SERTAD3Q9UJW9 196 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 DISP3Q9P2K9 1392 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 A0A1W2PS29 197 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 GAGE12BA1L429 117 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 AQP7P3A6NL99 342 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 CCP110O43303 1012 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 RRP9O43818 475 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 PIP5K1CO60331 668 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 SRGAP2O75044 1071 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 CDKL5O76039 1030 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 ZFPL1O95159 310 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 LAG3P18627 525 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 GATA3P23771 443 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 PRKAR1BP31321 381 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 ATICP31939 592 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 DGKEP52429 567 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 COPAP53621 1224 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 NPY5RQ15761 445 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 PFKFB4Q16877 469 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 PTCHD3Q3KNS1 767 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 TUBB8Q3ZCM7 444 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 SPATS1Q496A3 300 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 VPS53Q5VIR6 699 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 FCRL6Q6DN72 434 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 MICALCLQ6ZW33 695 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 SLC15A3Q8IY34 581 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 IL17DQ8TAD2 202 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 DNAJB14Q8TBM8 379 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM171Q8WVE6 324 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 NACC2Q96BF6 587 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 BOD1Q96IK1 185 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 CXorf36Q9H7Y0 433 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 RGL1Q9NZL6 768 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 CDY1Q9Y6F8 540 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1B-215ENST00000498054 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa5.08□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 PIP5K1BO14986 540 aa5.08□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 NPHP1O15259 732 aa5.08□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 COQ9O75208 318 aa5.08□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 CSTBP04080 98 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 KCNA3P22001 575 aa5.08□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 RAB30Q15771 203 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms