RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNPEPQ9ULA0 475 aa16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERBB2P04626 1255 aa16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTSHP09668 335 aa16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP3A5P20815 502 aa16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NDST1P52848 882 aa16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRB14Q14449 540 aa16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM132DQ14C87 1099 aa16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FUKQ8N0W3 1084 aa16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC4A11Q8NBS3 891 aa16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SHCBP1Q8NEM2 672 aa16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD33BA6NCL7 494 aa16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP2C9P11712 490 aa16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF484Q5JVG2 852 aa16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPDYCQ5MJ68 293 aa16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TLK2Q86UE8 772 aa16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL1R2P27930 398 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STX2P32856 288 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DGKDQ16760 1214 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NSMCE1Q8WV22 266 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSPH1Q92598 858 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACAP3Q96P50 834 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAIPQ9BWF2 469 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 B3GNT5Q9BYG0 378 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DPEP3Q9H4B8 488 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DPP3Q9NY33 737 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NME7Q9Y5B8 376 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PYGLP06737 847 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP11AP98196 1134 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTK6Q13882 451 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TLDC1Q6P9B6 456 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VSTM1Q6UX27 236 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM35BQ8NCS4 154 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRK7Q8WTQ7 553 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PARVAQ9NVD7 372 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 B4GALT4O60513 344 aa16.27■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSMA2P25787 234 aa16.27■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTGFP29279 349 aa16.27■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPS1Q13098 491 aa16.27■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKMY2Q8IV38 441 aa16.27■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIF2BQ8N4N8 673 aa16.27■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa16.27■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C3orf20Q8ND61 904 aa16.27■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MIS12Q9H081 205 aa16.27■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VPS37BQ9H9H4 285 aa16.27■□□□□ 0.2
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM191CA6NGB0 347 aa16.27■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MICAL2O94851 1124 aa16.27■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC1A1P43005 524 aa16.27■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC26A2P50443 739 aa16.27■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARSEP51690 589 aa16.27■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM32Q13049 653 aa16.27■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RHBDF2Q6PJF5 856 aa16.27■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM121Q9BTD3 319 aa16.27■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBOX5O94941 541 aa16.26■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PGK1P00558 417 aa16.26■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPS6KA3P51812 740 aa16.26■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GAD2Q05329 585 aa16.26■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF677Q86XU0 584 aa16.26■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C4orf33Q8N1A6 199 aa16.26■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CXorf38Q8TB03 319 aa16.26■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CENPTQ96BT3 561 aa16.26■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 L3MBTL1Q9Y468 752 aa16.26■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa16.26■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RASA4BC9J798 803 aa16.26■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RASA4O43374 803 aa16.26■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MMRN1Q13201 1228 aa16.26■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa16.26■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD23Q86SG2 305 aa16.26■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINC01465Q8N7H1 131 aa16.26■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM11Q96F44 468 aa16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms