RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487284.2

CUX1-209, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene CUX1, Length 1,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-209ENST00000487284 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.96□□□□□ -0.01
CUX1-209ENST00000487284 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CUX1-209ENST00000487284 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CUX1-209ENST00000487284 WSCD1Q658N2 575 aa14.96□□□□□ -0.01
CUX1-209ENST00000487284 OSTM1Q86WC4 334 aa14.96□□□□□ -0.01
CUX1-209ENST00000487284 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CUX1-209ENST00000487284 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CUX1-209ENST00000487284 RUBCNQ92622 972 aa14.96□□□□□ -0.01
CUX1-209ENST00000487284 ZNF558Q96NG5 402 aa14.96□□□□□ -0.01
CUX1-209ENST00000487284 SNX25Q9H3E2 840 aa14.96□□□□□ -0.01
CUX1-209ENST00000487284 PATJQ8NI35 1801 aa14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 CHD9Q3L8U1 2897 aa14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 SIGLEC16A6NMB1 481 aa14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 FGGP02679 453 aa14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 ERBB2P04626 1255 aa14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 LINC00271P0C7V0 271 aa14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 LAG3P18627 525 aa14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 PAX3P23760 479 aa14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 RWDD2BP57060 319 aa14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 XYLT1Q86Y38 959 aa14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 NIPA2Q8N8Q9 360 aa14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 UBA3Q8TBC4 463 aa14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 MCEEQ96PE7 176 aa14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 LRRC1Q9BTT6 524 aa14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 GPR62Q9BZJ7 368 aa14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 DPEP3Q9H4B8 488 aa14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 TJP2Q9UDY2 1190 aa14.95□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 GABRDO14764 452 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 PSTPIP1O43586 416 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 TRAPPC3O43617 180 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 MCM3P25205 808 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 VSNL1P62760 191 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 C8orf74Q6P047 294 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 FUT10Q6P4F1 479 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 TTC30AQ86WT1 665 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 FNIP1Q8TF40 1166 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 IGSF21Q96ID5 467 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 MIS12Q9H081 205 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 FAM49BQ9NUQ9 324 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 KRIT1O00522 736 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 CYP11A1P05108 521 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 PYGMP11217 842 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 MYOGP15173 224 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 LMO2P25791 158 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 TKTP29401 623 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 OGDHQ02218 1023 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 TMEM86AQ8N2M4 240 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 STK32AQ8WU08 396 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 TNIP3Q96KP6 325 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 B3GALT6Q96L58 329 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 VN1R3Q9BXE9 311 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 SYNCQ9H7C4 482 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 HESX1Q9UBX0 185 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 GOLGA8SH3BPF8 625 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 ARHGEF15O94989 841 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 PDGFRBP09619 1106 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 KRT3P12035 628 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 TYMPP19971 482 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 TAS2R40P59535 323 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 LONRF2Q1L5Z9 754 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 RHOT1Q8IXI2 618 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 TMEM169Q96HH4 297 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 KRT12Q99456 494 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 PLVAPQ9BX97 442 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 AP1M1Q9BXS5 423 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 CHD7Q9P2D1 2997 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 ARHGEF37A1IGU5 675 aa14.92□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 SYN3O14994 580 aa14.92□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 EFEMP2O95967 443 aa14.92□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 CCDC130P13994 396 aa14.92□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CUX1-209ENST00000487284 LHX1P48742 406 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms