RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 PSMD6Q15008 389 aa18.07■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC6Q16204 474 aa18.07■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa18.07■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 UNC13DQ70J99 1090 aa18.07■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 KBTBD6Q86V97 674 aa18.07■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa18.07■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa18.07■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 BLZF1Q9H2G9 400 aa18.07■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 DPEP3Q9H4B8 488 aa18.07■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa18.07■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa18.06■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 F8VP50 259 aa18.06■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 TRIM66O15016 1216 aa18.06■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 AXIN1O15169 862 aa18.06■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC192P0DO97 292 aa18.06■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 TCF3P15923 654 aa18.06■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 ANXA13P27216 316 aa18.06■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 CACNA2D1P54289 1103 aa18.06■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa18.06■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 XXYLT1Q8NBI6 393 aa18.06■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 CD101Q93033 1021 aa18.06■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 FNBP1Q96RU3 617 aa18.06■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa18.06■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 LINC00597Q9H2U6 94 aa18.06■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 SNX25Q9H3E2 840 aa18.06■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM30AQ9NV96 361 aa18.06■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 TACC1O75410 805 aa18.05■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 EPN2O95208 641 aa18.05■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 TNNC1P63316 161 aa18.05■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 WDR72Q3MJ13 1102 aa18.05■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 FBXO43Q4G163 708 aa18.05■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 HS2ST1Q7LGA3 356 aa18.05■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 OR6B3Q8NGW1 331 aa18.05■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF516Q92618 1163 aa18.05■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 EXOC4Q96A65 974 aa18.05■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 CEP295NLQ96MC4 621 aa18.05■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 TTLL2Q9BWV7 592 aa18.05■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 MAGEF1Q9HAY2 307 aa18.05■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa18.05■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 MYOFQ9NZM1 2061 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF840PA6NDX5 716 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 LEFTY2O00292 366 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 RAP1GAPP47736 663 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 CASP4P49662 377 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 PDE6CP51160 858 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 MYL6P60660 151 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 NOP14P78316 857 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 CUL4BQ13620 913 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 DMC1Q14565 340 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 BMT2Q1RMZ1 405 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 PPM1JQ5JR12 505 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 SYT13Q7L8C5 426 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 CAMKK1Q8N5S9 505 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 PLEKHO2Q8TD55 490 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 C8orf48Q96LL4 319 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 XYLT2Q9H1B5 865 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC39A2Q9NP94 309 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 CACNA1BQ00975 2339 aa18.04■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 ZFHX4Q86UP3 3567 aa18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 CLDN5O00501 218 aa18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 AKAP3O75969 853 aa18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 NFATC1O95644 943 aa18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 AFMP43652 599 aa18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 PSMD2Q13200 908 aa18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 GAB4Q2WGN9 574 aa18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 ACDQ96AP0 544 aa18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 LOXL4Q96JB6 756 aa18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 ELOVL4Q9GZR5 314 aa18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 RNF38Q9H0F5 515 aa18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 SMOC1Q9H4F8 434 aa18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 SMYD3Q9H7B4 428 aa18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 RXFP3Q9NSD7 469 aa18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 CPQQ9Y646 472 aa18.03■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 ANTXRLA6NF34 631 aa18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 A8MXQ7 604 aa18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 APBB3O95704 486 aa18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 STAU1O95793 577 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SKIV2L-211ENST00000485349 OLFM2O95897 454 aa18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms