RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 SLC25A3Q00325 362 aa16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 CDK16Q00536 496 aa16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 RHBDF2Q6PJF5 856 aa16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 TTC25Q96NG3 672 aa16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 TMCO1Q9UM00 188 aa16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 NENFQ9UMX5 172 aa16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 FSCN2O14926 492 aa16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 FAM83AQ86UY5 434 aa16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 LRRIQ4A6NIV6 560 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 IVDP26440 423 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 NCOA4Q13772 614 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 CYP1B1Q16678 543 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 GSTA3Q16772 222 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 KCTD21Q4G0X4 260 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM67Q6ZTA4 783 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 SESTD1Q86VW0 696 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 OR6Y1Q8NGX8 325 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 MECRQ9BV79 373 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 DNPEPQ9ULA0 475 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 VWA5AO00534 786 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 TP73O15350 636 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 KRT39Q6A163 491 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 SV2AQ7L0J3 742 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ULK2Q8IYT8 1036 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 NT5C1BQ96P26 610 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 SIKE1Q9BRV8 207 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 INHBAP08476 426 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 MFAP3P55082 362 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 DLG1Q12959 904 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 LSAMPQ13449 338 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 KIF22Q14807 665 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM121Q9BTD3 319 aa16.93■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 CYP11B1P15538 503 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 AQP4P55087 323 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 AGBL3Q8NEM8 1001 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 CNBD2Q96M20 576 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PAFAH2Q99487 392 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 SENP1Q9P0U3 644 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ACTL7BQ9Y614 415 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 FUT4P22083 530 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 BASP1P80723 227 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 FSTL1Q12841 308 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 HIC1Q14526 733 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 CYTH1Q15438 398 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 DENND1AQ8TEH3 1009 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 GDPD5Q8WTR4 605 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PANX3Q96QZ0 392 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 RAB20Q9NX57 234 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PIM2Q9P1W9 311 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 GTF3C4Q9UKN8 822 aa16.92■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 CLPTM1O96005 669 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PEX2P28328 305 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ABCD1P33897 745 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 NSFP46459 744 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 LIG4P49917 911 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 GTF2BQ00403 316 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 GAD2Q05329 585 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 HIF1AQ16665 826 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF394Q53GI3 561 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 TMPRSS6Q8IU80 811 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ICA1LQ8NDH6 482 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 IWS1Q96ST2 819 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 STRA6Q9BX79 667 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 KLHL4Q9C0H6 718 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 SLC7A8Q9UHI5 535 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 UBE4BO95155 1302 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 AQP5P55064 265 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 FMO1Q01740 532 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 GALNT4Q8N4A0 578 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 FBXL13Q8NEE6 735 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 SHKBP1Q8TBC3 707 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 SYT11Q9BT88 431 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 EXOC7Q9UPT5 735 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D12O60347 775 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 KRT1P04264 644 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ASLP04424 464 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PHBP35232 272 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PRKCEQ02156 737 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ALCAMQ13740 583 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PDK3Q15120 406 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 SLC44A4Q53GD3 710 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 SFT2D3Q587I9 215 aa16.91■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms