RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 NCANO14594 1321 aa22.07■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 DPYSL4O14531 572 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 PRAMEF12O95522 483 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 PSMC3P17980 439 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 ADORA2BP29275 332 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 AVPR1AP37288 418 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 KCNK16Q96T55 309 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 SLC46A2Q9BY10 475 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 BRD9Q9H8M2 597 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 COL4A3Q01955 1670 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 FAM200BP0CF97 657 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 WEE1P30291 646 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 TXNDC8Q6A555 127 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 MFSD6LQ8IWD5 586 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 NUP93Q8N1F7 819 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 THAP9Q9H5L6 903 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.06■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 KRBA1A5PL33 1030 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 SOBPA7XYQ1 873 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 COL9A1P20849 921 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 RFX1P22670 979 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 GDI1P31150 447 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 MON1AQ86VX9 555 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 YAF2Q8IY57 180 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 FLCNQ8NFG4 579 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 RSPRY1Q96DX4 576 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 SLC5A3P53794 718 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 RAD23BP54727 409 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 MAP3K7CLP57077 242 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 DNASE1L2Q92874 299 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 IRF7Q92985 503 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 SMOQ99835 787 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 OBP2AQ9NY56 170 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 GCNT4Q9P109 453 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa22.03■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 CKMP06732 381 aa22.03■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.03■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.03■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.03■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 LMO3Q8TAP4 145 aa22.03■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.03■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 ZNF263O14978 683 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 BEST1O76090 585 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 YWHAQP27348 245 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 PPP3CCP48454 512 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 FCHO2Q0JRZ9 810 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 TAF10Q12962 218 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 PDZD8Q8NEN9 1154 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 BPIFB1Q8TDL5 484 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 FBXO32Q969P5 355 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 TDP1Q9NUW8 608 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 C2orf78A6NCI8 922 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-208ENST00000481121 STK25O00506 426 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-208ENST00000481121 TNFRSF10BO14763 440 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-208ENST00000481121 USP17L7P0C7H9 530 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-208ENST00000481121 NPR3P17342 541 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-208ENST00000481121 PDE6CP51160 858 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-208ENST00000481121 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NELFE-208ENST00000481121 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-208ENST00000481121 UBR7Q8N806 425 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-208ENST00000481121 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-208ENST00000481121 SHDQ96IW2 340 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-208ENST00000481121 TBC1D17Q9HA65 648 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-208ENST00000481121 CCL26Q9Y258 94 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-208ENST00000481121 CHADO15335 359 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-208ENST00000481121 ABL1P00519 1130 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-208ENST00000481121 GCNT1Q02742 428 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-208ENST00000481121 PRKCQQ04759 706 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-208ENST00000481121 STX1AQ16623 288 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-208ENST00000481121 MAN2A1Q16706 1144 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-208ENST00000481121 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.01■■□□□ 1.11
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