RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 CALUO43852 315 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 NOL4O94818 638 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 KIF20AO95235 890 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 NR3C1P04150 777 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 PRR29P0C7W0 189 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 KRT13P13646 458 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CMA1P23946 247 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 ADORA2BP29275 332 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 HOXC13P31276 330 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 NDUFA8P51970 172 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 SEC13P55735 322 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 USP46P62068 366 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 DLG4P78352 724 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 AMPD2Q01433 879 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 FAM160A1Q05DH4 1040 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 DMWDQ09019 674 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 SPEM2Q0P670 501 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 TAF10Q12962 218 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 NR1H3Q13133 447 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 NCOA4Q13772 614 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CFAP221Q4G0U5 840 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CNNM4Q6P4Q7 775 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 FAM171BQ6P995 826 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 C1orf228Q6PIY5 440 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 ACOT1Q86TX2 421 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 SPEM1Q8N4L4 309 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 SUMF1Q8NBK3 374 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 KIAA0895Q8NCT3 520 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 FBXO32Q969P5 355 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 RMDN1Q96DB5 314 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CHFRQ96EP1 664 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 MSANTD3Q96H12 275 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 SLITRK1Q96PX8 696 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 PKMYT1Q99640 499 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 B3GNT5Q9BYG0 378 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 KIF9Q9HAQ2 790 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 C2orf42Q9NWW7 574 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 SDK1Q7Z5N4 2213 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 KLRC4O43908 158 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 RNF40O75150 1001 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 TADA3O75528 432 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 EGFP01133 1207 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM49P0CI25 452 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM49CP0CI26 452 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC192P0DO97 292 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 IRF1P10914 325 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 P4HA1P13674 534 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CD58P19256 250 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 WEE1P30291 646 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 MAGEA11P43364 429 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 GALK1P51570 392 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 GAS6Q14393 721 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 PDGFRLQ15198 375 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 BMT2Q1RMZ1 405 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 SPOPLQ6IQ16 392 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 VSTM1Q6UX27 236 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC150Q8NCX0 1101 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 SPATA18Q8TC71 538 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 PLEKHO2Q8TD55 490 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 PARD3BQ8TEW8 1205 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 OSCP1Q8WVF1 389 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 ATP2A3Q93084 1043 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 EXOC4Q96A65 974 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 EEF2KMTQ96G04 330 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 HHIPQ96QV1 700 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 KCNK16Q96T55 309 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 P2RY13Q9BPV8 354 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 IMPG2Q9BZV3 1241 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 ELOVL4Q9GZR5 314 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00597Q9H2U6 94 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 HPS4Q9NQG7 708 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 KRT82Q9NSB4 513 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 FAM49BQ9NUQ9 324 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 EHD2Q9NZN4 543 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 USP25Q9UHP3 1055 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 ZDHHC9Q9Y397 364 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 GPR179Q6PRD1 2367 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 LEFTY2O00292 366 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ATG13O75143 517 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 TACC1O75410 805 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 AP1G2O75843 785 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC130P13994 396 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 NR2F2P24468 414 aa8.58□□□□□ -1.04
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