RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 ADORA2BP29275 332 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 RAD23BP54727 409 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 NT5C1BQ96P26 610 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 THAP9Q9H5L6 903 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 OBP2AQ9NY56 170 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 EHD2Q9NZN4 543 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 MAP3K7CLP57077 242 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 NUP93Q8N1F7 819 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 IL37Q9NZH6 218 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 DPYSL4O14531 572 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 FAM200BP0CF97 657 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 COL9A1P20849 921 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 YWHAQP27348 245 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 SLC5A3P53794 718 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 PFKPQ01813 784 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 KAT5Q92993 513 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF3Q9NR81 526 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 GCNT4Q9P109 453 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 C2orf78A6NCI8 922 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 ZNF840PA6NDX5 716 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 GDI1P31150 447 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 AVPR1AP37288 418 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 FCHO2Q0JRZ9 810 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 TAF10Q12962 218 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 SLC22A12Q96S37 553 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 CYP2S1Q96SQ9 504 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 BRD9Q9H8M2 597 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 COMMD8Q9NX08 183 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 CCL26Q9Y258 94 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 HHLA1C9JL84 531 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 ZNF263O14978 683 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 PPP3CCP48454 512 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP17Q68EM7 881 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 RRAGAQ7L523 313 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 FLCNQ8NFG4 579 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 DNASE1L2Q92874 299 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 TDP1Q9NUW8 608 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 OBSL1O75147 1896 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 FAM92AA1XBS5 289 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 ARNTLO00327 626 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 CHADO15335 359 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 AVPR2P30518 371 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 GCNT1Q02742 428 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 YAF2Q8IY57 180 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 BPIFB1Q8TDL5 484 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 IRF7Q92985 503 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 DUSP16Q9BY84 665 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 TRPV5Q9NQA5 729 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 ZNF318Q5VUA4 2279 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 STARD6P59095 220 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 MAN2A1Q16706 1144 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms