RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472161.1

RPS3AP49-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 49, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP49, Length 790 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP49-201ENST00000472161 SV2CQ496J9 727 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 SLC39A12Q504Y0 691 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 C1orf220Q5T0J3 134 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 TANGO2Q6ICL3 276 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 VITQ6UXI7 678 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 CCDC105Q8IYK2 499 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 SYCP3Q8IZU3 236 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 LRRC52Q8N7C0 313 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 RIN3Q8TB24 985 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 ELMO3Q96BJ8 720 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 FAM122AQ96E09 287 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 MCRS1Q96EZ8 462 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 ASB16Q96NS5 453 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 LRRC3BQ96PB8 259 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 FOXQ1Q9C009 403 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 XYLT2Q9H1B5 865 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 TMEM206Q9H813 350 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 ARHGEF3Q9NR81 526 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 GDAP2Q9NXN4 497 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 WNT16Q9UBV4 365 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 ITGA11Q9UKX5 1188 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 CFAP45Q9UL16 551 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 MAFFQ9ULX9 164 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 AGAP1Q9UPQ3 857 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 DNAH14Q0VDD8 3507 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 ECI2O75521 394 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 MICAL2O94851 1124 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 LDHAP00338 332 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 ITGB2P05107 769 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 PTPN2P17706 415 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 CLCN5P51795 746 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 DLG4P78352 724 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 KRT85P78386 507 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 BFSP1Q12934 665 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 GRM2Q14416 872 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 PSMD6Q15008 389 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 TEAD2Q15562 447 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 ZCWPW2Q504Y3 356 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 MTSS1LQ765P7 747 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 WDR49Q8IV35 697 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 FLCNQ8NFG4 579 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 TMEM174Q8WUU8 243 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 PSMG2Q969U7 264 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 NXPE3Q969Y0 559 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 CHFRQ96EP1 664 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 SPATA32Q96LK8 384 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 ZNF560Q96MR9 790 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 CGRRF1Q99675 332 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 TBC1D17Q9HA65 648 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 TRPV4Q9HBA0 871 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 CRTAC1Q9NQ79 661 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 DMAC2Q9NW81 257 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 FAM13BQ9NYF5 915 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 GDE1Q9NZC3 331 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 HSFX1Q9UBD0 423 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RPS3AP49-201ENST00000472161 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 A0A1W2PQ27 194 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 A0A1W2PQ64 194 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 A0A1W2PQD8 194 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 H0Y858 1186 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 PRMT3O60678 531 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 ATP2C2O75185 946 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 VNN1O95497 513 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 CST3P01034 146 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 RPN1P04843 607 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 MYL4P12829 197 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 PAX3P23760 479 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 LMO2P25791 158 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 MSX1P28360 303 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 ELF1P32519 619 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 PNPLA4P41247 253 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 VIPR2P41587 438 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 MAP2K3P46734 347 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 CACNA2D1P54289 1103 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 EPHA4P54764 986 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 STARD6P59095 220 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 CYP4F8P98187 520 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 AMPD3Q01432 767 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 FZD5Q13467 585 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 SDHAF4Q5VUM1 108 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3AP49-201ENST00000472161 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms