RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGEA11P43364 429 aa7.46□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 MXI1P50539 228 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC63Q05C16 580 aa7.46□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 PAK1Q13153 545 aa7.46□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF394Q53GI3 561 aa7.46□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 MAB21L3Q8N8X9 362 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC4A11Q8NBS3 891 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 SCAMP5Q8TAC9 235 aa7.46□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 TSG101Q99816 390 aa7.46□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZFP14Q9HCL3 533 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM49BQ9NUQ9 324 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 WNT16Q9UBV4 365 aa7.46□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 EML5Q05BV3 1969 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMA7O14818 248 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CILPO75339 1184 aa7.45□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 FBXL21Q9UKT6 434 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 ANTXRLA6NF34 631 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TULP2O00295 520 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 AP1G2O75843 785 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMC3P17980 439 aa7.44□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 WEE1P30291 646 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CDC25CP30307 473 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 HOXC13P31276 330 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 SOX9P48436 509 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 MAP3K7CLP57077 242 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TNK2Q07912 1038 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TAF10Q12962 218 aa7.44□□□□□ -1.22
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