RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 MON1AQ86VX9 555 aa17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 SMOQ99835 787 aa17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 PNPLA8Q9NP80 782 aa17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 KRT82Q9NSB4 513 aa17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM49BQ9NUQ9 324 aa17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 GCNT4Q9P109 453 aa17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFRSF10BO14763 440 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 PAEPP09466 180 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 PFKLP17858 780 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 FCARP24071 287 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM65Q6PJ69 517 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 RRAGAQ7L523 313 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 ARHGEF19Q8IW93 802 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 STKLD1Q8NE28 680 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 ZMIZ2Q8NF64 920 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 BPIFA3Q9BQP9 254 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC46A2Q9BY10 475 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 DUSP16Q9BY84 665 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 UBXN6Q9BZV1 441 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 FANCLQ9NW38 375 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 OBP2AQ9NY56 170 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 WNT16Q9UBV4 365 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 CNTN6Q9UQ52 1028 aa17.86■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM92AA1XBS5 289 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 TADA3O75528 432 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 BEST1O76090 585 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 VDRP11473 427 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC9A1P19634 815 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 PTPRDP23468 1912 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 PON1P27169 355 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 YWHAQP27348 245 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 ADORA2BP29275 332 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 USP46P62068 366 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 CYP4F8P98187 520 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM31Q5JXX7 168 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 STXBP5Q5T5C0 1151 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 CLEC20AQ6ZU45 233 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 OVCA2Q8WZ82 227 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 KAT5Q92993 513 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 ASIC4Q96FT7 647 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 KREMEN1Q96MU8 473 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 CRACR2AQ9BSW2 395 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 C11orf16Q9NQ32 467 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa17.85■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 NCANO14594 1321 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRC10BA6NIK2 292 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 NPR3P17342 541 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 MFAP3P55082 362 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 MAP3K7CLP57077 242 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 TAF10Q12962 218 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 NCAPHQ15003 741 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM270Q6UE05 265 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 MFSD6LQ8IWD5 586 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 CMTM8Q8IZV2 173 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD52Q8NB46 1076 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 PDZD8Q8NEN9 1154 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 SLITRK1Q96PX8 696 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 KXD1Q9BQD3 176 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 FUCA2Q9BTY2 467 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 SMOC2Q9H3U7 446 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 FBXO44Q9H4M3 255 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 APEX2Q9UBZ4 518 aa17.84■□□□□ 0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF840PA6NDX5 716 aa17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM221A6NGB7 291 aa17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 HEPACAM2A8MVW5 462 aa17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 PRR33A8MZF0 331 aa17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 HHLA1C9JL84 531 aa17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 M0R296 226 aa17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 NARSO43776 548 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 PSMC3P17980 439 aa17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 VIPR2P41587 438 aa17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 PDE6CP51160 858 aa17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF132P52740 706 aa17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC5A3P53794 718 aa17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 GPC5P78333 572 aa17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 PFKPQ01813 784 aa17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 STILQ15468 1287 aa17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 ANO6Q4KMQ2 910 aa17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 SGO2Q562F6 1265 aa17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 SNX30Q5VWJ9 437 aa17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 TXNDC8Q6A555 127 aa17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 MAB21L3Q8N8X9 362 aa17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 SMTNL1A8MU46 457 aa17.82■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 TPM2P07951 284 aa17.82■□□□□ 0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF18P17022 549 aa17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms