RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 CKMP06732 381 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 CCDC130P13994 396 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ARSAP15289 507 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 CTHP32929 405 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 PMS1P54277 932 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 PON2Q15165 354 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 NFIL3Q16649 462 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 PAQR9Q6ZVX9 377 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ACOT1Q86TX2 421 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 SPATA17Q96L03 361 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 TWNKQ96RR1 684 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 KCNK16Q96T55 309 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 NELL2Q99435 816 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 MED10Q9BTT4 135 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 EBF3Q9H4W6 596 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 LMAN1LQ9HAT1 526 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 HPS4Q9NQG7 708 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 GKN1Q9NS71 199 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 FAM49BQ9NUQ9 324 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 SDK1Q7Z5N4 2213 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 MAPK13O15264 365 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 NCAM2O15394 837 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ASS1P00966 412 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 CHRNB1P11230 501 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 KRT13P13646 458 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 RPS9P46781 194 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 NDST1P52848 882 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 NOP14P78316 857 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 GAS6Q14393 721 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 Q6ZS52 159 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 SMARCE1Q969G3 411 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 CHFRQ96EP1 664 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 C8orf48Q96LL4 319 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 KRT82Q9NSB4 513 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 GCNT4Q9P109 453 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ZNF292O60281 2723 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 IKBKBO14920 756 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 BEST1O76090 585 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ABL1P00519 1130 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 FAM163BP0C2L3 166 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 CD58P19256 250 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 HOXC13P31276 330 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ZXDBP98169 803 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 PLCB2Q00722 1185 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 TAF10Q12962 218 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 USP4Q13107 963 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 MTF1Q14872 753 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ZNF77Q15935 545 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 FUKQ8N0W3 1084 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 C12orf29Q8N999 325 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 SEMA4DQ92854 862 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 CCDC34Q96HJ3 373 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 TTLL2Q9BWV7 592 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 CHRDQ9H2X0 955 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 RMND1Q9NWS8 449 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 C2orf42Q9NWW7 574 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 AP1G2O75843 785 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 USP17L7P0C7H9 530 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 HDCP19113 662 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 ADORA2BP29275 332 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 MAGEA9P43362 315 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 RUNX3Q13761 415 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 SPATA20Q8TB22 786 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 TAF4BQ92750 862 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 JAKMIP2Q96AA8 810 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 TNIP3Q96KP6 325 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 GSDMAQ96QA5 445 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms