RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 ACO1P21399 889 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 POLE2P56282 527 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 CYP4X1Q8N118 509 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 AGR3Q8TD06 166 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 USP33Q8TEY7 942 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 C12orf42Q96LP6 360 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 TXNDC16Q9P2K2 825 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 GRIN2DO15399 1336 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 HUS1O60921 280 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 PPFIA2O75334 1257 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 KRT7P08729 469 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 MMP8P22894 467 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 PAX7P23759 505 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 PSEN1P49768 467 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 GDF10P55107 478 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 MXRA7P84157 204 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 DGKDQ16760 1214 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 MAP7D3Q8IWC1 876 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 ZFP42Q96MM3 310 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 APOL2Q9BQE5 337 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 MROH8Q9H579 483 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 KLHL14Q9P2G3 628 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 CASTOR2A6NHX0 329 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 PGK1P00558 417 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 MT-ND3P03897 115 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 LMNB2Q03252 620 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 BEST2Q8NFU1 509 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 SDCBP2Q9H190 292 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 DPEP3Q9H4B8 488 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 CES2O00748 559 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 RECQL4O94761 1208 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 HOXC6P09630 235 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 SESN3P58005 492 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 BMPR2Q13873 1038 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 CCL14Q16627 93 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 CES3Q6UWW8 571 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 PACS2Q86VP3 889 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 FBXO36Q8NEA4 188 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 SYT11Q9BT88 431 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 FSCN2O14926 492 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 GRIN3BO60391 1043 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 IL1R2P27930 398 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 ABCG1P45844 678 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 ARL4CP56559 192 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 CORO7P57737 925 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 EXD1Q8NHP7 514 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 RUBCNQ92622 972 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 CPP00450 1065 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 GPD1P21695 349 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 ACVR2BQ13705 512 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 EML3Q32P44 896 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 ANKRD22Q5VYY1 191 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 MIPOL1Q8TD10 442 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 SMYD2Q9NRG4 433 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 PCYOX1Q9UHG3 505 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM191CA6NGB0 347 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 KRT4P19013 534 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 IL9RQ01113 521 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 SETDB1Q15047 1291 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 EDEM1Q92611 657 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 PSTPIP1O43586 416 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 CETPP11597 493 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 TNFRSF8P28908 595 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 GBP1P32455 592 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 MBTD1Q05BQ5 628 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC20A2Q08357 652 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGEF1-210ENST00000437078 GPR142Q7Z601 462 aa14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms