RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427412.5

CITED1-204, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-204ENST00000427412 ATG13O75143 517 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 ITGB3P05106 788 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 TNNI1P19237 187 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 BMP6P22004 513 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 PMS1P54277 932 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 SHC2P98077 582 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 RUNX3Q13761 415 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 LRRTM3Q86VH5 581 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 METTL23Q86XA0 190 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 RIN3Q8TB24 985 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 NELFBQ8WX92 580 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 CGRRF1Q99675 332 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 GKN1Q9NS71 199 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 DPP3Q9NY33 737 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 CCL26Q9Y258 94 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 ABCA7Q8IZY2 2146 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 CYB561D2O14569 222 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 TNNC2P02585 160 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 F11P03951 625 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 AVPR1AP37288 418 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 NLRP12P59046 1061 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 SURF1Q15526 300 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 ZCWPW2Q504Y3 356 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 KBTBD6Q86V97 674 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 THEM5Q8N1Q8 247 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 CAMKK1Q8N5S9 505 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 OR5B17Q8NGF7 314 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 EBF3Q9H4W6 596 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 MMRN2Q9H8L6 949 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 RXFP3Q9NSD7 469 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 TDP1Q9NUW8 608 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 FAM208BQ5VWN6 2430 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 AXIN1O15169 862 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 RNF40O75150 1001 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 TADA3O75528 432 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 RPL13P26373 211 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 PXNP49023 591 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 BFSP1Q12934 665 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 PAK1Q13153 545 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 ADAM9Q13443 819 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 PSMD6Q15008 389 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 TAF12Q16514 161 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 SV2CQ496J9 727 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 WSCD1Q658N2 575 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 ANKRD40Q6AI12 368 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 TRIM68Q6AZZ1 485 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 NT5DC4Q86YG4 428 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 SLC9A9Q8IVB4 645 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 FAM186BQ8IYM0 893 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 MAB21L3Q8N8X9 362 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 C1orf127Q8N9H9 656 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 TRIML1Q8N9V2 468 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 PLEKHO2Q8TD55 490 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 GIPC2Q8TF65 315 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 ZNF560Q96MR9 790 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 DMAC2Q9NW81 257 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 AGAP1Q9UPQ3 857 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 SLC8A2Q9UPR5 921 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 CETN3O15182 167 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 EGFP01133 1207 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 TRIM49P0CI25 452 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 TRIM49CP0CI26 452 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 CSH1P0DML2 217 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 CSH2P0DML3 217 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 CCDC192P0DO97 292 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 EPB41P11171 864 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 DRD1P21728 446 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 MPLP40238 635 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 PPP1R2P41236 205 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 AMPD2Q01433 879 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 USP4Q13107 963 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 BIRC3Q13489 604 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 CCDC6Q16204 474 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 EDRF1Q3B7T1 1238 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 FBXO43Q4G163 708 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 COBLL1Q53SF7 1204 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 SCARA3Q6AZY7 606 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 MON1AQ86VX9 555 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 WDR49Q8IV35 697 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-204ENST00000427412 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.2 ms