RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411265.1

RNU6-1001P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1001, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1001P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SCARB1Q8WTV0 552 aa2.76□□□□□ -1.97
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RNU6-1001P-201ENST00000411265 GALNT16Q8N428 558 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RUNDC1Q96C34 613 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RITA1Q96K30 269 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
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