RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPON1Q9HCB6 807 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 PREBQ9HCU5 417 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 POGKQ9P215 609 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 POLG2Q9UHN1 485 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 LMTK3Q96Q04 1460 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 A0A087X0M5 115 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 A0A1B0GX30 115 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM90A18PA6NE21 464 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM90A16PA6NEW6 464 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 EFCAB8A8MWE9 144 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 B4GALT4O60513 344 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 RASAL1O95294 804 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 INHBBP09529 407 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 CNPP09543 421 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM90A15PP0C7V4 464 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM90A14PP0C7W9 464 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 PI3P19957 117 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 PXNP49023 591 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 MCM2P49736 904 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF134P52741 427 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 LILRA4P59901 499 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 KIAA2012Q0VF49 1180 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 GPS1Q13098 491 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 RINT1Q6NUQ1 792 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 TAF2Q6P1X5 1199 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 NEK10Q6ZWH5 1172 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM124AQ86V42 546 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP38Q8NB14 1042 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 CPT1CQ8TCG5 803 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 ABHD5Q8WTS1 349 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 ST8SIA2Q92186 375 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 VPS16Q9H269 839 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 SEC61A2Q9H9S3 476 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 NOD2Q9HC29 1040 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 IRAK4Q9NWZ3 460 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 DNAJB11Q9UBS4 358 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 VPS51Q9UID3 782 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 OAZ3Q9UMX2 235 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 CDYLQ9Y232 598 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-272P-201ENST00000411028 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 E7ENX8 843 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 E7EVH7 732 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 J3KTA2 159 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 RGS10O43665 173 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 MFAP3LO75121 409 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 TFRCP02786 760 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 RXRAP19793 462 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 CR2P20023 1033 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 KLRK1P26718 216 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 RPS19P39019 145 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 CHN2P52757 468 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 TAP2Q03519 686 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 MYO1EQ12965 1108 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 GRM4Q14833 912 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 SURF1Q15526 300 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 METRNLQ641Q3 311 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF280DQ6N043 979 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 C16orf54Q6UWD8 224 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 RRAGAQ7L523 313 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 TTC30AQ86WT1 665 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPARTQ8N0X7 666 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 MDGA1Q8NFP4 955 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 C3orf49Q96BT1 292 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 ERP27Q96DN0 273 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 LRIG1Q96JA1 1093 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 C7orf26Q96N11 449 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 DPYSL5Q9BPU6 564 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 TTPALQ9BTX7 342 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 PTDSS2Q9BVG9 487 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 AGXT2Q9BYV1 514 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 RNPEPQ9H4A4 650 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 NDUFAF4Q9P032 175 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 NFU1Q9UMS0 254 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-272P-201ENST00000411028 CNTN6Q9UQ52 1028 aa4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms