RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403807.3

VPREB1-202, Transcript of V-set pre-B cell surrogate light chain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VPREB1, Length 755 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1-202ENST00000403807 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 C2CD4DB7Z1M9 353 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 TNFRSF10AO00220 468 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 TEX33O43247 280 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 MED7O43513 233 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 BEST1O76090 585 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 NPR3P17342 541 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 KLK7P49862 253 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 ZNF132P52740 706 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 UBASH3AP57075 661 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 NR1I3Q14994 352 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 SLC5A9Q2M3M2 681 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 GJD3Q8N144 294 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 FGF13Q92913 245 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 TCEAL4Q96EI5 215 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 MYADMQ96S97 322 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 UBXN6Q9BZV1 441 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 GDE1Q9NZC3 331 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 EPS15L1Q9UBC2 864 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 TSPAN16Q9UKR8 245 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 FHOD1Q9Y613 1164 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 UNC80Q8N2C7 3258 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 A0A1W2PRU2 124 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 F11P03951 625 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 LAMP2P13473 410 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 CCR2P41597 374 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 PPP3CCP48454 512 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 BPIFB4P59827 614 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 PTK2Q05397 1052 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 LCLAT1Q6UWP7 414 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 GAREM2Q75VX8 874 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 RNF214Q8ND24 703 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 STKLD1Q8NE28 680 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 ING5Q8WYH8 240 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 TFAP2BQ92481 460 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 TTLL2Q9BWV7 592 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 GANQ9H2C0 597 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 FBXO44Q9H4M3 255 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 IL21Q9HBE4 155 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 PNPLA8Q9NP80 782 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 A0A1W2PQC6 194 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 O00370 1275 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 TNFRSF10BO14763 440 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 CYP26A1O43174 497 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 MOSPD3O75425 235 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 TPM3P06753 285 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 GJA1P17302 382 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 CEBPBP17676 345 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 YWHAQP27348 245 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 GNA15P30679 374 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 SLC5A3P53794 718 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 BCAT1P54687 386 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 USP46P62068 366 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 BST2Q10589 180 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 TEAD2Q15562 447 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 NPAS3Q8IXF0 933 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 SHKBP1Q8TBC3 707 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 ZNF606Q8WXB4 792 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 SPAG5Q96R06 1193 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 SOBPA7XYQ1 873 aa14.47□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 THAP12O43422 761 aa14.47□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 SETSIPP0DME0 302 aa14.47□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 CLCN1P35523 988 aa14.47□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 PDE4CQ08493 712 aa14.47□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 TAF10Q12962 218 aa14.47□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 GPR158Q5T848 1215 aa14.47□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.47□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 TTC30AQ86WT1 665 aa14.47□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 PDZD8Q8NEN9 1154 aa14.47□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.47□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 UBA3Q8TBC4 463 aa14.47□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 OVCA2Q8WZ82 227 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms