RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 FUKQ8N0W3 1084 aa19.64■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 TWNKQ96RR1 684 aa19.64■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 MED10Q9BTT4 135 aa19.64■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 TTLL2Q9BWV7 592 aa19.64■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 FOXQ1Q9C009 403 aa19.64■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 COQ4Q9Y3A0 265 aa19.64■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 KANSL1LA0AUZ9 987 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 ARNTLO00327 626 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 CHADO15335 359 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 CCDC130P13994 396 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 CD58P19256 250 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 AVPR1AP37288 418 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 PLA2G5P39877 138 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 TCF15Q12870 199 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 CCDC40Q4G0X9 1142 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 TPRG1Q6ZUI0 275 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 PJA1Q8NG27 643 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 BPIFB1Q8TDL5 484 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM122AQ96E09 287 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 SMARCD1Q96GM5 515 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 FAXDC2Q96IV6 333 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 NT5C1AQ9BXI3 368 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 EHD2Q9NZN4 543 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 SIT1Q9Y3P8 196 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 CILPO75339 1184 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 CD72P21854 359 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 PTPN5P54829 565 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 WDR44Q5JSH3 913 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 CCDC105Q8IYK2 499 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 C12orf29Q8N999 325 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC2A14Q8TDB8 520 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 TATDN2Q93075 761 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 KCNK16Q96T55 309 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 CLSTN2Q9H4D0 955 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 TRPC7Q9HCX4 862 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 KRT82Q9NSB4 513 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM49BQ9NUQ9 324 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 TDP1Q9NUW8 608 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 CCL26Q9Y258 94 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 SHISA7A6NL88 538 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 AP1G2O75843 785 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 DCNP07585 359 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 NHLH1Q02575 133 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 UBXN2BQ14CS0 331 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 NUP93Q8N1F7 819 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 WHAMMQ8TF30 809 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 ZFYVE19Q96K21 471 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC22A12Q96S37 553 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 KIF9Q9HAQ2 790 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 LTB4R2Q9NPC1 389 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 GCNT4Q9P109 453 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 C2orf78A6NCI8 922 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 CKMP06732 381 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 USP17L7P0C7H9 530 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 FMO5P49326 533 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 TAF10Q12962 218 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 TTC39CQ8N584 583 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 DTWD2Q8NBA8 298 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 ZMIZ2Q8NF64 920 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 CYFIP2Q96F07 1278 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 SLITRK1Q96PX8 696 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 CYP2S1Q96SQ9 504 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 SMOQ99835 787 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 ARID3AQ99856 593 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 OSBPL6Q9BZF3 934 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 LMBRD1Q9NUN5 540 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF840PA6NDX5 716 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 TNFRSF10BO14763 440 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 BEST1O76090 585 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 TARSP26639 723 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 YWHAQP27348 245 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 ADORA2BP29275 332 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 PPP3CCP48454 512 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 PLCB2Q00722 1185 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF394Q53GI3 561 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF852Q6ZMS4 543 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 NELL2Q99435 816 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 DNAI2Q9GZS0 605 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-201ENST00000366391 CISHQ9NSE2 258 aa19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms