RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 SLC5A3P53794 718 aa15.84■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 MFSD6LQ8IWD5 586 aa15.84■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 UBR7Q8N806 425 aa15.84■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 SLC4A11Q8NBS3 891 aa15.84■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 RIN3Q8TB24 985 aa15.84■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa15.84■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 SLC22A12Q96S37 553 aa15.84■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 MFSD1Q9H3U5 465 aa15.84■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 TRPC7Q9HCX4 862 aa15.84■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 CCL26Q9Y258 94 aa15.84■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa15.84■□□□□ 0.13
CSAG1-201ENST00000361211 C2orf78A6NCI8 922 aa15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 TNFRSF10BO14763 440 aa15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 P4HA2O15460 535 aa15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 WEE1P30291 646 aa15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 RAD23BP54727 409 aa15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 MAP3K7CLP57077 242 aa15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 CLEC20AQ6ZU45 233 aa15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 MON1AQ86VX9 555 aa15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 CREBRFQ8IUR6 639 aa15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGEF19Q8IW93 802 aa15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM105Q8N8V8 129 aa15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 SCAMP5Q8TAC9 235 aa15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 CYFIP2Q96F07 1278 aa15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 BRD9Q9H8M2 597 aa15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 TBC1D17Q9HA65 648 aa15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 HEBP1Q9NRV9 189 aa15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 SHISA7A6NL88 538 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 ARNTLO00327 626 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 DPYSL4O14531 572 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 PI15O43692 258 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 FAM200BP0CF97 657 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 AVPR2P30518 371 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 AVPR1AP37288 418 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 FCHO2Q0JRZ9 810 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 TAF10Q12962 218 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 SLC44A4Q53GD3 710 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 NUP93Q8N1F7 819 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 JAKMIP2Q96AA8 810 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 E2F7Q96AV8 911 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM176AQ96HP8 235 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 ZFYVE19Q96K21 471 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 NT5C1BQ96P26 610 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 CYP2S1Q96SQ9 504 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 OBP2AQ9NY56 170 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 GCNT4Q9P109 453 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 PATJQ8NI35 1801 aa15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 HHLA1C9JL84 531 aa15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF263O14978 683 aa15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 MBD3O95983 291 aa15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 ACO1P21399 889 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 YWHAQP27348 245 aa15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 PFKPQ01813 784 aa15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 TPRG1Q6ZUI0 275 aa15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 PPM1KQ8N3J5 372 aa15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 TTC39CQ8N584 583 aa15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 EHBP1Q8NDI1 1231 aa15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 BPIFB1Q8TDL5 484 aa15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 DNASE1L2Q92874 299 aa15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 FBXO32Q969P5 355 aa15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 FOXQ1Q9C009 403 aa15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 THAP9Q9H5L6 903 aa15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 IL37Q9NZH6 218 aa15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 DACH1Q9UI36 760 aa15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 ZMYM5Q9UJ78 669 aa15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa15.81■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 MYH10P35580 1976 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF840PA6NDX5 716 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 SOBPA7XYQ1 873 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 CHADO15335 359 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 AOC1P19801 751 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 CD72P21854 359 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 PGFP49763 221 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 STARD6P59095 220 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG1-201ENST00000361211 CETN1Q12798 172 aa15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms